番木瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子的基因表達(dá)譜及其功能的初步研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、植物在面對大自然中各種生物脅迫和非生物脅迫時會采用多種機(jī)制來適應(yīng)環(huán)境。在植物與自然的相互作用研究過程中,越來越多的學(xué)者開始關(guān)注植物體在基因水平上的調(diào)節(jié)作用。近幾年,有關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的研究已逐漸成為當(dāng)今植物基因組的一個熱點。WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物體中起著應(yīng)答各種生物脅迫與非生物脅迫的重要調(diào)節(jié)作用,分離植物WRKY家族的不同成員并鑒定其功能是闡明植物抗逆分子機(jī)制的重要途徑。
   本研究首先利用SUPERFAMILY數(shù)據(jù)庫,得到推測的番

2、木瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸序列,借助Genebank數(shù)據(jù)庫資源建立了本地的番木瓜Genome和EST數(shù)據(jù)庫,從而利用tBlastn工具獲得了番木瓜45個WRKY轉(zhuǎn)錄因子的編碼序列。對其中13個WRKY基因進(jìn)行脅迫誘導(dǎo),利用熒光定量PCR技術(shù)檢測基因表達(dá)水平,選取其中一個表達(dá)差異明顯的WRKY基因進(jìn)行初步的功能研究?,F(xiàn)主要獲得以下結(jié)果:
   1.在番木瓜中發(fā)現(xiàn)45個WRKY轉(zhuǎn)錄因子,獲得其推測的基因編碼序列,并將其分為4類。在

3、SUPERFAMILY數(shù)據(jù)庫中搜索得到56個WRKY結(jié)構(gòu)域分布于50個蛋白質(zhì)中,經(jīng)過序列比對、除去冗余之后得到45個WRKY轉(zhuǎn)錄因子及氨基酸序列。借助已經(jīng)完成測序的番木瓜基因組,利用tBlastn工具獲得了這45個番木瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子的編碼序列。根據(jù)所含WRKY結(jié)構(gòu)域的個數(shù)和鋅指結(jié)構(gòu)的類型,將其分為4類:第Ⅰ類含有6個,第Ⅱ類含有30個,第Ⅲ類含有7個,第Ⅳ類含有2個。
   2.通過水楊酸(SA)、低溫、干旱、創(chuàng)傷、病原侵染

4、等多種脅迫誘導(dǎo),得到13個番木瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子的基因表達(dá)譜。利用熒光定量PCR技術(shù),對脅迫處理后的番木瓜苗在轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行分析,檢測其中13個WRKY轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)量變化。結(jié)果顯示,這13個番木瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子除evm.TU.supercontig_1.102(以下簡稱為TF1.102)外,其他轉(zhuǎn)錄WRKY因子受生物脅迫或非生物脅迫誘導(dǎo)表達(dá),其中TF12.199,TF807.3,TF9.353個WRKY轉(zhuǎn)錄因子對5種處理都受誘導(dǎo),說明

5、這13個WRKY轉(zhuǎn)錄因子中有12個或多或少在抗脅迫反應(yīng)中起到了一定的調(diào)控作用。
   3.成功克隆得到一個番木瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因的全長編碼區(qū)。分析番木瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子的基因表達(dá)譜,選取其中一個表達(dá)差異明顯的WRKY基因TF8073進(jìn)行RT-PCR克隆,得到了一個558bp的cDNA序列,經(jīng)測序與蛋白質(zhì)保守結(jié)構(gòu)域分析,確定其為番木瓜WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族的一員。
   4.利用農(nóng)桿菌滲透法,將TF807.3在番木瓜葉片

6、中瞬時超表達(dá),發(fā)現(xiàn)番木瓜抗病相關(guān)基因CpSGT1和CpRAR1表達(dá)水平明顯上調(diào)。通過構(gòu)建植物超表達(dá)載體pCAMBIA3300-TF807.3,轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌GV3101中,構(gòu)建農(nóng)桿菌介導(dǎo)的番木瓜瞬時表達(dá)體系,分析TF8073超表達(dá)的番木瓜葉片中抗病相關(guān)基因SGT1和RAR1的表達(dá)差異。結(jié)果顯示,在農(nóng)桿菌侵染3d后,TF8073在番木瓜葉片中得到超表達(dá),SGT1和RAR1的表達(dá)量分別上調(diào)2.4倍和4.5倍,說明TF807.3參與到SGT1和

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