11523.癌相關(guān)基因arhgap26和neil1的airna編輯和相關(guān)調(diào)控機制的研究

1、學號：201100370005分類號：碩士學位論文碩士學位論文癌相關(guān)基因ARHGAP26和NEIL1的AIRNA編輯和相關(guān)調(diào)控機制的研究ThestudyonAIRNAeditingregulationmechanismofcancerrelatedgenesARHGAP26NEIL1研究生姓名：馬俊指導教師：鄭秋生教授汪莉副研究員學科門類：工學專業(yè)名稱：生物化工論文提交日期：2014年6月I摘要RNA編輯是重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制，其中AI

2、RNA編輯是最重要最普遍的編輯現(xiàn)象，AIRNA編輯反應主要由特定的RNA腺苷脫氨酶（ADAR）家族介導催化。它能識別特定的雙鏈RNA結(jié)構(gòu)和mRNA前體，催化底物上的腺苷酸（A）水解脫氨成為次黃嘌呤（I），在翻譯過程中I通常會被核糖體識別為鳥氨酸G，由此編輯就會導致核酸序列或者密碼子的改變。RNA編輯可以影響mRNA的穩(wěn)定性和micrNA的加工成熟以及改變micrNA對其底物分子的識別等一系列重要的生物過程。目前已知的ADAR酶家族包括A

3、DAR1、ADAR2、ADAR3和TADAR。在四種編輯酶中，ADAR1是目前研究得最廣泛的編輯酶之一?，F(xiàn)代的RNAseq高通量測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)，RNA編輯事件在人類基因組中普遍存在，主要發(fā)生于基因組非編碼的重復序列和CDS區(qū)。AIRNA編輯和人類疾病的發(fā)生發(fā)展一直是近年來該領(lǐng)域的研究熱點。大量的研究表明AIRNA編輯與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，例如肝癌，皮膚癌，腦癌等。與相應的正常細胞相比，在癌細胞中RNA編輯效率明顯改變，相應編輯酶的

4、表達失調(diào)。本課題正是針對于癌相關(guān)的基因，檢測其癌與正常的編輯效率差異，初步探討該基因的RNA編輯與癌癥的潛在關(guān)系。本課題對抑癌基因ARHGAP26的3’UTR，NEIL1的CDS區(qū)的編輯事件進行初步研究。分別在腦腫瘤細胞，白血病患者的白細胞和乳腺癌細胞中實驗驗證癌相關(guān)的基因ARHGAP26，NEIL1的潛在編輯位點，通過實驗確證了ARHGAP26，NEIL1中AIRNA編輯事件的存在，并且編輯效率表現(xiàn)出組織差異性。進一步本課題比較了癌和

5、正常組織或細胞中的RNA編輯效率，實驗發(fā)現(xiàn)相對于正常的組織或細胞系，ARHGAP26基因在腦腫瘤細胞中編輯效率明顯下降，基因NEIL1在白血病患者白細胞中編輯效率顯著下降，在乳腺癌細胞系中明顯下降。因此本研究以基因在癌和正常中的編輯差異為線索，來探究該基因編輯事件的調(diào)控機制和潛在的功能影響。首先實驗驗證發(fā)現(xiàn)，在腦腫瘤患者的組織細胞中ARHGAP26基因發(fā)生了AIRNA編輯，主要關(guān)注的12個編輯位點全部集中在ARHGAP263’UTR區(qū)域