油菜莢果轉(zhuǎn)錄組測序分析及油分相關(guān)候選基因的鑒別.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、甘藍(lán)型油菜（Brassica napus）由白菜（B.rapa）與甘藍(lán)（B.oleracea）在約7500年前雜交形成，經(jīng)過染色體加倍，形成了異源多倍體。在中國乃至世界，油菜是第二大油料作物，中國人的營養(yǎng)供給中占據(jù)著很重要的地位。隨著測序技術(shù)的發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組測序已廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)的各研究領(lǐng)域。目前油菜全基因組序列已經(jīng)發(fā)表，為轉(zhuǎn)錄組水平研究油分含量的遺傳發(fā)育機(jī)制奠定了良好基礎(chǔ)。本研究在開花后的三個不同時期，利用二代測序平臺Illumina

2、 Hiseq2000對中國品種高油和德國品種Sollux的莢果進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，分析基因差異表達(dá)，并對表達(dá)基因進(jìn)行基因本體和通路分析。隨后與擬南芥脂質(zhì)代謝數(shù)據(jù)庫中的相關(guān)基因、油菜油分含量相關(guān)QTL等信息等進(jìn)行整合分析，挖掘和分析候選功能基因。主要結(jié)果如下:
　　1、相同時期品種間和相同品種不同時期間分別檢測到465和2114個顯著差異表達(dá)基因;
　　2、鑒別出八個品種間差異表達(dá)基因與擬南芥脂質(zhì)代謝通路相關(guān)基因同源。分析了品種內(nèi)

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