膠質(zhì)瘤惡性進(jìn)展相關(guān)新基因研究.pdf

1、蘇州大學(xué)博士學(xué)位論文膠質(zhì)瘤惡性進(jìn)展相關(guān)新基因研究姓名：孫繼勇申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專(zhuān)業(yè)：神經(jīng)外科學(xué)指導(dǎo)教師：黃強(qiáng)20030401腔質(zhì)瘤惡性進(jìn)展相關(guān)新基因研究中文摘要析表明，其中有1l條基因的功能信息與誘導(dǎo)分化關(guān)系密切，可能是這一過(guò)程的關(guān)鍵基因。結(jié)論：生物信息學(xué)是分析基因表達(dá)譜的有力工具，可以很好的從表達(dá)譜數(shù)據(jù)提取出與膠質(zhì)瘤惡性進(jìn)展和誘導(dǎo)分化相關(guān)的關(guān)鍵基因，本文利用這一先進(jìn)工具篩選出了28條可能是膠質(zhì)瘤惡性進(jìn)展過(guò)程中的關(guān)鍵基因供進(jìn)一步研究。第

2、二部分半定量RTPCR驗(yàn)證膠質(zhì)瘤相關(guān)新基因的表達(dá)利用基因芯片和生物信息學(xué)手段從大量的基因中篩選腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中重要的新調(diào)控基因，是目前腫瘤功能基因組研究的一個(gè)重要研究方向。但是小樣本量的檢測(cè)有時(shí)會(huì)出現(xiàn)一些假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果，因此很有必要抽取部分樣本和基因進(jìn)行驗(yàn)證。本文利用半定量RTPCR檢測(cè)了上文中篩選出來(lái)的28條基因中的7條基因在膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)’情況，目的：一方面驗(yàn)證以前的基因芯片數(shù)據(jù)的可靠性；另一方面通過(guò)對(duì)基因表達(dá)水平的半定量

3、，進(jìn)行橫向的對(duì)比，希望能夠找出這些基因在不同級(jí)別膠質(zhì)瘤中的表達(dá)規(guī)律，為進(jìn)一步的功能研究提供依據(jù)。方法：按照7條基因的GenBank登錄號(hào)，檢索GenBank得到這些基因的全長(zhǎng)cDNA序列，然后設(shè)計(jì)相應(yīng)的PCR引物，針對(duì)22例惡性膠質(zhì)瘤病人的腫瘤組織作檢測(cè)，22例膠質(zhì)瘤按照WHO分級(jí)其中I級(jí)3例，II級(jí)8例，III級(jí)7例，IV級(jí)4例，最后利用SmartView電泳圖像分析軟件對(duì)各個(gè)基因在不同組織中的表達(dá)進(jìn)行半定量。結(jié)果：這些基因在這些腫瘤

4、中的表達(dá)差異是有規(guī)律性的，和以前的基因芯片結(jié)果基本一致。如X54304(肌球蛋白輕鏈)、A1264216(膽堿轉(zhuǎn)運(yùn)因子2)都是隨著惡性程度的進(jìn)展而表達(dá)升高，而NM019896(DNA多聚酶p12亞基)、NM015962(CGI35蛋自)、AB037886(NESH蛋白)、D38305(Tob蛋白)、M87507(半胱天冬酶1，Caspasel)都是隨著惡性程度的進(jìn)展而表達(dá)降低。結(jié)論：我們對(duì)于基因芯片和生物信息學(xué)技術(shù)篩選到的7條基因作半定