水稻分子圖譜的構(gòu)建及其初步研究.pdf

1、水稻是世界上最重要的糧食作物之一，世界上半數(shù)以上的人口以水稻為主食，大多數(shù)水稻重要農(nóng)藝性狀如產(chǎn)量、品質(zhì)、抗逆性等多為數(shù)量性狀，因此對數(shù)量性狀基因位點(diǎn)(QTLs)準(zhǔn)確定位分析在水稻遺傳改良上具有重要意義。尤其是利用全基因組完成測序的材料進(jìn)行數(shù)量性狀研究，為進(jìn)一步開展QIL功能解析打下基礎(chǔ)，本研究選用兩個測序水稻品種“培矮64S和日本晴”，配制雜交組合“培矮64S/日本晴”F<,1>構(gòu)建重組自交系群體“F<,2：8>310個株系”，并對RI

2、L群體進(jìn)行評價，用該群體構(gòu)建了一張SSR標(biāo)記連鎖圖譜“簡稱F<,8>圖譜”，將該圖分別與相同組合F<,2>群體圖譜和日本晴序列圖比，分析分離標(biāo)記的概況，其主要結(jié)果如下： 1.利用組合雜種“培矮64S/日本晴”F<,1>建立重組自交系(RIL)群體，分別在四川和海南種植；F<,2>、F<,4>、F<,6>、F<,8>在四川溫江種植，F(xiàn)<,1>、F<,3>、F<,5>、F<,7>在海南凌水種植，最后得到310個F<,2：8>株系。重

3、組自交系RIL群體性狀評檢測評價結(jié)果為；分蘗數(shù)、穗數(shù)、株高3類性狀純合度分別為60.61％、90％、50.61％，分子標(biāo)記評價結(jié)果為：RIL群體純合度為96.03％，雜合度為3.97％。 2.選用515對SSR引物對雙親培矮64S和日本晴間進(jìn)行多態(tài)性檢測，有157對引物在雙親間表現(xiàn)明顯多態(tài)性，多態(tài)性頻率為30.48％，以此構(gòu)建了包含109個標(biāo)記的連鎖圖(簡稱F<,8>圖譜)，該圖譜包含18個連鎖群，覆蓋基因組2732.6cM，標(biāo)

4、記間平均距離25.07cM。 3.本圖譜分別與F<,2>圖譜進(jìn)行比較，兩圖在連鎖群、標(biāo)記定位數(shù)、標(biāo)記順序、總基因組長度、標(biāo)記平均距離等方面都存在差異。進(jìn)一步與日本晴序列圖比較，109個標(biāo)記有91個標(biāo)記能確定在基因組序列圖上，有18個標(biāo)記未能在序列圖找到相應(yīng)的位置，91個標(biāo)記覆蓋的物理距離為159.8Mb，標(biāo)記間平均物理距離為2159.46kb。 4.在RIL群體中偏分離標(biāo)記較多；定位在F<,8>圖譜有63個分子標(biāo)記表現(xiàn)偏

5、分離(P<0.05)，占定位標(biāo)記數(shù)的68.48％,這些偏分離標(biāo)記中有60個偏向母本培矮64S，只有3個標(biāo)記偏向父本日本晴；另外還有48個未定位標(biāo)記，其中27個標(biāo)記偏分離、21個正常分離，可能與偏分離有關(guān)。 5.F<,8>圖上12條染色體上共分布了60個偏分離標(biāo)記，占偏分離標(biāo)記的95.24％，這些標(biāo)記以成簇的形式分布在染色體，形成偏分離的熱點(diǎn)區(qū)，分別命名為：SDR1-1、SDR1-2、SDR2、SDR3-1、SDR3-2、SDR4