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1、低分子量麥谷蛋白是小麥谷蛋白的主要組成部分(約占60%),在很大程度上決定著小麥的加工品質(zhì)。編碼LMW-GS的基因位于小麥第一同源群1A、1B和1D染色體短臂上,分別稱為Glu-A3、Glu-B3和Glu-D3(統(tǒng)稱Glu-3)。低分子量麥谷蛋白亞基受多基因控制,并且在染色體上與醇溶蛋白基因緊密連鎖,在SDS-PAGE上又不易與醇溶蛋白區(qū)分,所以低分子量麥谷蛋白的研究存在著很大難度。本研究以四倍體小麥Langdon BAC文庫(kù)為材料,從
2、中篩選鑒定小麥低分子量谷蛋白基因,為深入認(rèn)識(shí)低分子量谷蛋白基因家族的成員組成、分布與進(jìn)化等特點(diǎn)奠定基礎(chǔ)。本研究的主要結(jié)果如下: 1.利用保守引物對(duì)Langdon BAC文庫(kù)初篩獲得的BAG克隆進(jìn)行PCR二次篩選,鑒定出25個(gè)陽性克隆,PCR克隆測(cè)序獲得26條基因序列,根據(jù)推斷的氨基酸序列分類原則,它們分屬LMW-i、s和m三種類型,其中i型的有9個(gè),s型的有11個(gè),m型的有6個(gè)。通過聚類分析,26個(gè)基因被分為5類。 2.
3、根據(jù)不同類型基因序列之間的SNP設(shè)計(jì)了5對(duì)特異引物,特異引物能將不同類型的低分子量麥谷蛋白基因區(qū)分開來,并且這些引物在四倍體小麥Langdon及其代換系和六倍體小麥中國(guó)春及其缺體一四體中都表現(xiàn)出特異性,26個(gè)基因被定位到1A或1B染色體上。 3.代表性BAC克隆459F23的測(cè)序與分析表明,該BAC克隆全長(zhǎng)大約為175kb,含有CACTA、gypsy、copia和LINE等重復(fù)序列,一個(gè)不表達(dá)的低分子量麥谷蛋白基因、抗白粉病基因
4、片段、RFLP標(biāo)記SFR159,以及一些其它的基因片段。BAC克隆817007,全長(zhǎng)大約為103kb,序列分析表明,該BAC克隆含有CACTA、MITE和gypsy等重復(fù)序列,一個(gè)M型的低分子量麥谷蛋白基因、HBP-1a轉(zhuǎn)錄因子和RFLP標(biāo)記SFR159。與四倍體小麥Langdon中其他一些BAG序列的微共線性分析表明,低分子量麥谷蛋白基因與RFLP標(biāo)記SFR159具有很好的共線性。同時(shí),根據(jù)SFR159序列的相似性和SFR159與LM
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