食管鱗狀細(xì)胞癌差異甲基化片段的篩選及相關(guān)基因的鑒定.pdf

1、中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)（北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院）博士學(xué)位論文食管鱗狀細(xì)胞癌差異甲基化片段的篩選及相關(guān)基因的鑒定姓名：趙保健申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：遺傳學(xué)指導(dǎo)教師：馬旭;吳爾若20080601北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博士研究生學(xué)位論文息學(xué)分析表明這7 個(gè)片段均含有許多轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。2 ．食管鱗狀細(xì)胞癌中差異甲基化片斷的進(jìn)一步鑒定和分析2 ．1 啟動(dòng)子區(qū)呈異常高甲基化的基因2 ．1 ．1 T P E F 基因的異常甲基化對(duì)2 2 例食管癌患者進(jìn)行了基因組和表達(dá)

2、水平的檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)2 2 例患者中有1 2例患者的腫瘤中發(fā)生了T P E F 基因啟動(dòng)子區(qū)的高甲基化( 5 4 ．5 ％) ，并伴隨著表達(dá)的下調(diào)。細(xì)胞系實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)在加入去甲基化藥物5 7 ．A Z A 作用后，隨著啟動(dòng)子區(qū)甲基化水平的降低，T P E F 基因的表達(dá)有明顯的表達(dá)回復(fù)。2 ．1 ．2E D N R B 基因的異常甲基化對(duì)2 1 例食管癌患者進(jìn)行了基因組和表達(dá)水平的檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)2 l 例患者中有5 例腫瘤組織中發(fā)生了E D N R

3、 B 基因啟動(dòng)子區(qū)的高甲基化( 2 3 ．8 ％) ，并伴隨著表達(dá)的下調(diào)。細(xì)胞系實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)在加入去甲基化藥物5 ' - A Z A 作用后，E D N R B 基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化水平降低，并伴有E D N R B 基因明顯的表達(dá)回復(fù)。2 ．2 ．長(zhǎng)片斷甲基化區(qū)域在食管鱗狀細(xì)胞癌中的初步研究發(fā)現(xiàn)高甲基化片段H M D F 3 ( E D N R B ) 和H M D F l 2 均定位于染色體1 3 q 2 2 ．3 ，中間區(qū)域長(zhǎng)約

4、1 ．5 M ，含有多個(gè)參與重要功能代謝的基因。細(xì)胞系實(shí)驗(yàn)表明，經(jīng)去甲基化藥物處理后一定程度上恢復(fù)了該區(qū)域內(nèi)的大部分基因表達(dá)。結(jié)論：本論文應(yīng)用M S A P ．P C R 的方法對(duì)食管鱗狀細(xì)胞癌進(jìn)行了全基因組甲基化分析，獲得特異的D N A 甲基化差異圖譜，篩選到一些具有重要意義的片段。首次報(bào)道了T P E F 基因與E D N R B 基因的啟動(dòng)子區(qū)在食管鱗狀細(xì)胞癌中呈異常高甲基化狀態(tài)，從而影響了該基兇的正常表達(dá)。此外首次對(duì)食管鱗狀細(xì)