基于ndhF序列的中國懸鉤子屬植物系統(tǒng)發(fā)育初步研究.pdf

1、懸鉤子屬（Rubus L.），又名樹莓屬，隸屬薔薇科(Rosaceae)。中國作為懸鉤子屬植物的起源和重要分布中心之一，有201種，98變種，其中特有種138種。樹莓是懸鉤子屬植物中果實(shí)可食用的用于園藝栽培的特色果樹種類，在中國野生樹莓資源極其豐富。但由于該屬在植物分類上存在較多的分歧，給野生樹莓種質(zhì)鑒定和評價(jià)帶來了極大的困難。只有明晰其相關(guān)類群系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系才可能從根本上解決這些問題。目前，細(xì)胞學(xué)手段已經(jīng)顯得捉襟見肘，而分子系統(tǒng)學(xué)手段在

2、該領(lǐng)域中的應(yīng)用存在諸多空白或不足。本研究正是基于此，立足中國懸鉤子屬，側(cè)重優(yōu)良野生樹莓集中的空心莓組和木莓組，利用及進(jìn)化速率較快的葉綠體基因編碼區(qū)ndhF序列，評價(jià)其在該屬中的進(jìn)化和系統(tǒng)學(xué)價(jià)值，構(gòu)建支持率較高的中國懸鉤子屬植物的分子系統(tǒng)樹，以期對該屬植物的系統(tǒng)發(fā)育和優(yōu)良野生樹莓種質(zhì)的分類和鑒定提供參考依據(jù)。主要結(jié)果如下:
　　1、葉綠體ndhF序列在中國懸鉤子屬植物中的系統(tǒng)應(yīng)用價(jià)值。所有供試材料的葉綠體ndhF序列經(jīng)過對比排列后長

3、度為1182 bp，GC含量為34.3％，AT含量為65.7％。以薔薇屬黃刺玫(Rosa xanthina)和草莓屬野草莓（Fragaria vesca）為外類群，對比排序后，共檢測到ndhF序列變異位點(diǎn)和信息位點(diǎn)分別為88個(gè)和47個(gè)，占7.44％和3.97％。空心莓組材料ndhF序列變異率為4.8％，而木莓組和刺毛莓組序列變異率僅為1.2％?；趎dhF序列的系統(tǒng)樹，一致性指數(shù)CI和保留性指數(shù)RI值均較高，分支自展值和后驗(yàn)概率較高，系

4、統(tǒng)樹的拓?fù)湎鄬Ψ€(wěn)定，對于所討論的問題有較高的支持度。
　　2、中國懸鉤子屬系統(tǒng)關(guān)系?；?6條ndhF序列構(gòu)建最大簡約法MP和貝葉斯推論BI系統(tǒng)樹表明，相較于外類群，中國懸鉤子屬植物為單系群。研究所涉及的空心莓組、木莓組和刺毛莓組材料分化較明顯，木莓組和刺毛莓組材料聚為一支，空心莓組材料則被劃分為幾支，呈現(xiàn)多系進(jìn)化現(xiàn)象。中國懸鉤子屬各組內(nèi)部所涉及材料并沒有完全按照形態(tài)學(xué)亞組的劃分進(jìn)行聚類，基于ndhF序列的聚類結(jié)果顯示各組材料相互