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文檔簡(jiǎn)介
1、浙江沿海越冬大黃魚年年有凍死,為了探索大黃魚應(yīng)對(duì)低溫環(huán)境時(shí)相關(guān)基因的表達(dá)變化,本實(shí)驗(yàn)?zāi)M了大黃魚越冬季節(jié)養(yǎng)殖環(huán)境,對(duì)大黃魚進(jìn)行室內(nèi)低溫協(xié)迫實(shí)驗(yàn),運(yùn)用 cDNA末端快速擴(kuò)增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技術(shù)克隆部分低溫相關(guān)基因的全長(zhǎng),并利用實(shí)時(shí)熒光定量(quantitative real-time PCR,qPCR)技術(shù)研究候選耐寒基因在正常越冬水溫(12℃)和急性、慢性降溫處理?xiàng)l件下相關(guān)組
2、織的表達(dá)量變化。研究結(jié)果如下:
大黃魚MIPS基因 cDNA全長(zhǎng)為2657bp,5′非編碼區(qū)(untranslated region,UTR)248bp,3′非編碼區(qū)750bp,開(kāi)放閱讀框?yàn)?659 bp,起于ATG和終于TAA,編碼一個(gè)由553個(gè)氨基酸組成的蛋白;大黃魚 SCD-1a基因 cDNA全長(zhǎng)為3125bp,5′非編碼區(qū)133bp,3′非編碼區(qū)1978bp,開(kāi)放閱讀框?yàn)?014 bp,起于ATG和終于TAA,編碼一個(gè)
3、由338個(gè)氨基酸組成的蛋白;大黃魚 SCD-1b基因 cDNA全長(zhǎng)為2647bp,5′非編碼區(qū)15bp,3′非編碼區(qū)1624bp,開(kāi)放閱讀框?yàn)?008 bp,起于ATG和終于TGA,編碼一個(gè)由336個(gè)氨基酸組成的蛋白。并對(duì)三個(gè)基因進(jìn)行跨膜域預(yù)測(cè),結(jié)果表明 SCD-1a和SCD-1b基因編碼的蛋白有明顯的跨膜區(qū),推測(cè)其為跨膜類蛋白。
大黃魚在正常越冬水溫(12℃)情況下,MIPS基因在鰓中表達(dá)量最高,在皮膚、腦、腎和脾組織中的表
4、達(dá)量低,而在肌肉、腸、肝、性腺和心組織中幾乎不表達(dá);大黃魚 SCD-1a基因主要在肝組織中表達(dá),SCD-1b基因主要在肝和肌肉組織中表達(dá),在其他組織中少量表達(dá)或幾乎不表達(dá);大黃魚 CIRP基因在10種組織中均有表達(dá),肝中表達(dá)量最高,性腺中表達(dá)最少。
緩慢降溫路線為:12℃→10℃→8℃→6℃,降溫速率為0.5℃/d。經(jīng)慢性低溫脅迫后,MIPS基因在鰓、皮膚、和心組織中均呈先顯著上升后顯著下降的趨勢(shì),腦和肌肉組織則在整個(gè)脅迫過(guò)程
5、中呈持續(xù)升高趨勢(shì)。CIRP基因在鰓、皮膚、腎和心四個(gè)組織中最先發(fā)生響應(yīng),隨后是肌肉組織。SCD-1a基因鰓組織呈升高趨勢(shì),脾、肌肉、腸和腦組織先升高后下降,肝組織呈下降趨勢(shì)。SCD-1b基因皮膚和腦呈現(xiàn)升高趨勢(shì),肌肉、腸和心組織先上升后下降,肝組織表達(dá)量持續(xù)在高水平,變化不顯著。
急性降溫幅度為:12℃→8℃,取樣時(shí)間點(diǎn)為0 h、0.5 h、2 h、4 h。經(jīng)急性性低溫脅迫后,MIPS基因除腸組織以外其他組織的表達(dá)量總體呈上升
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