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文檔簡介
1、[目的]
探討中國廣東粵西漢族人群候選基因CTLA-4、CD40單個SNP、單體型及SNP-SNP交互作用與Graves病發(fā)病及TRAb水平的關聯性,為進一步探究Graves病發(fā)病機制提供線索,并為其發(fā)病風險的預測及早期干預提供理論依據。
[方法]
采用病例-對照設計研究,采集Graves病患者及健康對照者的一般臨床資料,GD相關檢查指標及外周血樣本;選取覆蓋CTLA-4基因的常見9個常見SNPrs1024
2、161、rs5742909、rs231775、rs231777、rs231779、rs3087243、rs11571319、rs11571302、rs11571297),根據以往研究選定CD40基因與GD相關的候選位點rs1883832;采用高分辨率溶解曲線法(HRM)對常見SNP進行基因分型;哈代-溫伯格平衡檢驗分析種群中基因的隨機平衡性;采用Pearson卡方檢驗及Logistic回歸分析進行SNP與Graves病的關聯性分析;采用
3、卡方檢驗,多因子降維分析法(MDR)等方法分別對單倍型頻率分布、SNP-SNP交互作用,協(xié)方差分析及廣義線性模型分析(GLM) SNP與TRAb水平的關系。
[結果]
1.CTLA-4、CD40基因多態(tài)性與Graves病的相關性分析
CTLA-4基因中7個常見SNP(rs1024161、rs5742909、rs231775、 rs231777、rs231779、rs3087243、rs11571319)、C
4、D40基因的SNP rs1883832均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.01)。運用x2檢驗及Logistic回歸分析均顯示SNPrs231775、rs3087243及rs1883832的基因型及等位基因分布頻率在正常對照組和病例組中的分布均具有統(tǒng)計學意義(P<0.05);病例組rs231775的突變等位基因G頻率高于對照組,是GD易感的危險因素(ORx2=1.521,95%CI=1.159-1.996;ORLogisti
5、c=1.593,95%CI=1.202-2.112),而rs3087243和rs1883832的突變等位基因A、T則相反(rs3087243:ORx2=0.609,95%CI=0.467-0.794; ORLogistic=0.686,95%CI=0.520-0.903.rs1883832:ORx2=0.636,95%CI=0.497-0.815; ORLogistic=0.610,95%CI=0.472-0.790);多因素Logis
6、tic回歸分析表明性別、rs231775及rs1883832獨立與GD發(fā)病易感性相關。
2.CTLA-4基因的連鎖不平衡及單倍型分析
粵西漢族正常人群中CTLA-4基因中7個常見SNP(rs1024161、rs5742909、rs231775、 rs231777、rs231779、rs3087243、rs11571319)連鎖情況分析顯示SNP之間均D'<50%,r2<0.3,提示這些SNP之間可能不存在連鎖不平衡(
7、即達到了連鎖平衡)。單體型分析示較常見有6種單體型,其中TCGCTGC單體型增加GD發(fā)病風險2.565倍(OR=2.565,95%CI=1.883-3.495),而單體型TCACTAC則增加0.096倍(OR=0.096,95%CI=0.042-0.222)。
3.CTLA-4、CD40基因中SNP-SNP交互作用分析
MDR分析顯示CTLA-4基因SNP rs231775 GG基因型、rs231779 TT基因型及
8、rs3087243 GG基因型之間的交互作用可增加GD發(fā)病風險2.5349倍(OR=2.5349),未發(fā)現CTLA-4、CD40基因SNP之間有交互作用。
4.CTLA-4、CD40基因與GD初發(fā)患者TRAb滴度的關系單因素協(xié)方差分析及多因素廣義線性模型(GLM)分析均顯示家族史、SNPrs1024161、rs231779、rs231775與TRAb水平高低相關(P均小于0.05):有GD家族史、SNP rs1024161CC
9、基因型、rs231779C-基因型及rs231775GG基因型伴隨較高TRAb滴度,且以上因素獨立與TRAb水平相關。
[結論]
1.CTLA-4、CD40基因與廣東粵西漢族人群Graves病發(fā)病相關;其中,SNPrs231775突變等位基因G增加GD易感的風險,而SNPrs3087243與rs1883832的突變等位基因A、T則相反;SNPrs231775、rs231779及rs3087243之間的交互作用顯著增加
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