利用AFLP和SSR標記研究六個肉兔群體的遺傳多樣性.pdf

1、為進一步提高肉兔的產(chǎn)量和質(zhì)量，保證肉兔養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展，進行肉兔的遺傳育種改良、增加肉兔的遺傳多樣性已成為人們關(guān)注的課題。DNA分子標記所具有的穩(wěn)定性、準確性和可靠性使其能夠準確的反映生物的遺傳信息。本試驗利用AFLP和SSR兩種分子標記研究了6個肉兔群體的遺傳變異和遺傳結(jié)構(gòu)，以期為肉兔的遺傳育種工作提供一定的理論依據(jù)。 本研究對象為6個肉兔群體，其中GD14、GD24、、GD54、GD64來自于法國克里莫公司的商業(yè)配套系，新

2、西蘭兔來源于美國，蓮山黑兔來自中國本土。本試驗篩選了7對SSR引物和8對AFLP選擇性擴增引物組合。利用Popgen32軟件分析了群體內(nèi)的遺傳變異和群體間的遺傳結(jié)構(gòu)，計算群體間的遺傳距離，并利用MEGA3.1軟件，UPGMA法構(gòu)建6個群體的系統(tǒng)發(fā)生樹。兩種方法所得的結(jié)果如下： (1)利用八對AFLP引物組合共擴增出586個位點，其中有257個多態(tài)性位點，平均每個引物擴增出32.125個多態(tài)性的位點。七對SSR引物共擴增出39個等

3、位基因，平均每個位點為5.5714個。在檢測遺傳變異時兩種方法都表明6個群體均具有較高多態(tài)性，而且SSR檢測到的變異性明顯高于AFLP標記的檢測結(jié)果，兩種方法檢測的有效等位基因數(shù)(NE)分別為1.2885(AFLP)和3.0759(SSR)，AFLP檢測到的雜合度Nei(H)指數(shù)分布在0.1200和0.1556之間：SSR檢測的觀測雜合度分布在0.7679和0.8691之間。 (2)SSR有效等位基因數(shù)，香農(nóng)指數(shù)等遺傳變異參數(shù)明

4、顯高于AFLP技術(shù)，而AFLP能夠獲得比SSR技術(shù)更高效的多態(tài)位點數(shù)檢出率。盡管兩種方法所得的結(jié)果有些差別，但它們所得的6個群體的遺傳多樣性順序是一致的，，即蓮山黑兔群體的遺傳多樣性最高，接下來依次是GD14、GD24、新西蘭兔、GD64、GD54。檢測結(jié)果與群體的遺傳背景相符：蓮山黑兔為正在提純選育中的地方品種，雜合度最高；GD14、GD24為兩個專門化母系，雜合度較高；新西蘭兔為純種兔，雜合度較低；而GD64、GD54為兩個專門化父

5、系，雜合度最低。 (3)利用兩種方法計算的6個群體的遺傳距離分布在0.0155到0.0664(AFLP)之間和0.0350到0.5473(SSR)之間。兩種分子標記方法的聚類結(jié)果之間雖存在部分差異，基于兩種方法的遺傳距離所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹表明6個群體的聚類結(jié)果趨勢一致：GD14和GD24群體聚為一類；GD54和GD64聚為一類，接著這兩類聚在一起后和新西蘭兔聚在一起，然后蓮山黑兔經(jīng)過很長的距離與其他的群體聚在一起。該結(jié)果進一步印

6、證了6個肉兔群體的遺傳背景，為肉兔配套系中合理選擇使用育種材料、預(yù)測系間配合力提供了遺傳依據(jù)。 (4)應(yīng)用AFLP技術(shù)獲得一條蓮山黑兔特有的指紋條帶。 (5)根據(jù)試驗結(jié)果對雜交優(yōu)勢進行了預(yù)測，為肉兔的分子標記輔助育種的親本選擇方面提供理論依據(jù)。 (6)依據(jù)SSR和AFLP標記的原理，兩種方法揭示的肉兔基因組水平的遺傳多樣性信息不同，用兩種方法進行肉兔遺傳多樣性分析能為肉兔育種提供更加有用的信息。 通過對6