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文檔簡介
1、茄子(Solanum melongena L.)是亞洲和非洲許多國家重要的蔬菜作物之一。茄子的遺傳多樣性分析工作對(duì)茄子種質(zhì)資源的收集、保存、分類、鑒定以及育種都是非常必要的。本實(shí)驗(yàn)利用收集到的包括野生近緣種在內(nèi)的126份茄子材料進(jìn)行SSR分子標(biāo)記和形態(tài)學(xué)標(biāo)記以評(píng)價(jià)其種質(zhì)資源的遺傳多樣性。 1. 包括果實(shí)重量、果實(shí)直徑、果實(shí)長度、果形等在內(nèi)的12個(gè)性狀用于形態(tài)學(xué)標(biāo)記分析,利用DPS軟件將126份茄子材料劃分成兩個(gè)類群,第一類群中僅
2、包括130號(hào)材料,第二類群又可以分成6個(gè)簇。具有相同形態(tài)學(xué)性狀的材料都?xì)w于相應(yīng)的簇內(nèi)。 2. 利用正交設(shè)計(jì)的方法構(gòu)建了茄子10μl體積SSR反應(yīng)體系:Buffer為1μl,Mg2+為2.25mmol/L,dNTP為400μmol/L,上下游引物各為39.60ng,Taq聚合酶為0.75U,DNA約為100ng。PCR程序?yàn)?4℃預(yù)變性2min;然后進(jìn)行35個(gè)循環(huán)的94℃變性30s,52℃復(fù)性30s,72℃延伸45s;72℃延伸8
3、min后4℃保存。9個(gè)等位基因。有效等位基因數(shù)為1.9405個(gè),平均遺傳多樣性指數(shù)為0.748。 3. 利用茄子基因組DNA從番茄的700對(duì)SSR引物中篩選出19對(duì)多態(tài)性引物。這些引物在茄子上擴(kuò)增出105條特征條帶,每對(duì)引物檢測出的等位基因數(shù)在3~9之間,等位基因的平均數(shù)為4.8947個(gè),其中SSR116引物產(chǎn)生最多的。 4. 利用POPGENE軟件對(duì)126份材料上SSR標(biāo)記的數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,所有材料的相似系數(shù)跨度在0
4、.54到0.99之間。用非加權(quán)平均數(shù)算法得到所有試驗(yàn)材料的親緣關(guān)系聚類樹。所有材料被聚類成兩個(gè)類群,第一類群包括2份野生材料Solanum nigrum Linn(1)和S. Torvum(130),第二類群又可分成包括7份半栽培種紅茄的第一簇以及包括所有栽培種的第二簇。 5. 通過比較形態(tài)學(xué)標(biāo)記和SSR分子標(biāo)記的聚類樹,它們都得到了理想的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,都可以用于茄子遺傳多樣性和親緣關(guān)系的分析。根據(jù)茄屬植物的分類作為依據(jù),我們分析認(rèn)
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