基于EST-SSR和iPBS標(biāo)記的楊梅遺傳多樣性研究.pdf

1、楊梅(Morella rubra，舊稱Myrica rubra)是楊梅科楊梅屬亞熱帶常綠果樹，主要分布在長(zhǎng)江流域及以南地區(qū)，栽培歷史悠久，形成了豐富的品種和品系。本研究基于iPBS和EST-SSR兩種分子標(biāo)記技術(shù)分析了浙江、江蘇和福建等地區(qū)的楊梅主栽品種的遺傳多樣性和親緣關(guān)系。主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下:
　　1、從已報(bào)道的109個(gè)EST-SSR引物中篩選出21對(duì)高多態(tài)性引物，并從‘荸薺'楊梅轉(zhuǎn)錄組的UNIGENES序列中新篩選出62

2、個(gè)EST-SSR位點(diǎn)，開發(fā)了17條高多態(tài)性EST-SSR引物。應(yīng)用這38對(duì)引物對(duì)56份楊梅樣品和一個(gè)云南楊梅(M.nana)進(jìn)行擴(kuò)增，共獲得214個(gè)等位基因，平均每個(gè)SSR位點(diǎn)有6個(gè)等位基因，觀測(cè)雜合度(Ho)平值為0.61;期望雜合度(He)的平均值為0.57;多態(tài)信息含量(PIC)平均值為0.56。
　　2、優(yōu)化了iPBS擴(kuò)增體系，并從已報(bào)道的18條引物中篩選出8條多態(tài)性較好、擴(kuò)增條帶清晰的iPBS引物。應(yīng)用這8條引物對(duì)35份

3、楊梅樣品和一個(gè)云南楊梅進(jìn)行擴(kuò)增，共獲得67個(gè)條帶，其中有54個(gè)為多態(tài)性條帶，多態(tài)性百分率為81％;每條引物可擴(kuò)增出5-12條條帶，平均8.4條。
　　3、利用38對(duì)EST-SSR引物對(duì)56份楊梅樣品進(jìn)行擴(kuò)增，STRUCRURE結(jié)果顯示將其劃分為5個(gè)基因庫(kù)，余姚白梅擁有獨(dú)立的基因庫(kù)，遺傳來(lái)源較單一，從親緣地理上來(lái)看，福建楊梅品種的基因來(lái)源單一，基因庫(kù)獨(dú)立，江蘇地區(qū)多數(shù)品種與浙江北部品種的遺傳背景相近;UPGMA聚類樹將56份楊梅材料