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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
本研究通過(guò)對(duì)2009~2014年福建省甲型H1N1流感(甲流)病毒的分子流行病學(xué)特征進(jìn)行分析,結(jié)合本省流感的監(jiān)測(cè)情況,旨在探索該病毒在我省的基因變異和分子特征,掌握流感流行的趨勢(shì),為預(yù)測(cè)疫苗的防治效果及防控甲流疫情提供科學(xué)依據(jù)。
方法:
收集106株源自福建省各哨點(diǎn)醫(yī)院流感樣病例的甲流病毒毒株,通過(guò)RT-PCR和測(cè)序方法獲得HA和NA基因的全長(zhǎng)序列。運(yùn)用分子生物學(xué)軟件和統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對(duì)序列進(jìn)行拼接、比對(duì)
2、和分析,以甲流病毒疫苗株 A/California/07/2009(H1N1)為參考毒株,從多個(gè)方面對(duì)我省甲流的分子流行病學(xué)進(jìn)行研究,結(jié)合流感監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)來(lái)揭示甲流在我省的流行規(guī)律和變異特征。
結(jié)果:
1、2009~2014年福建省甲流經(jīng)歷了流行消長(zhǎng)的反復(fù)過(guò)程,近兩年的流行強(qiáng)度更是加大,2014年下半年處于流行低谷,但很有可能迎來(lái)新的流行高峰。
2、同源進(jìn)化分析顯示,福建省甲流病毒HA基因與疫苗株的核苷酸和氨基
3、酸的同源性分別在97.6%~99.6%和97.2%~99.1%之間;NA基因則分別在98.7%~99.6%和97.4%~99.6%之間。隨著時(shí)間的推移,HA基因和NA基因的進(jìn)化樹均逐漸形成6個(gè)分支,HA蛋白上的S143G、H138R、V249L、V234I、K163Q、S185T、S451N和NA蛋白上的K432E、V241I發(fā)生突變可能是導(dǎo)致毒株聚集成不同分枝的重要原因,其中H138R和S143G分別位于抗原決定簇Ca上和其周圍,K1
4、63Q和S185T則分別位于抗原決定簇Sa和Sb上。
3、抗原性分析顯示,2009~2014年期間福建省甲流病毒 HA蛋白中共有97個(gè)氨基酸位點(diǎn)發(fā)生變化,其中有17個(gè)氨基酸位點(diǎn),變異累計(jì)涉及4個(gè)抗原決定簇,也有部分毒株在190螺旋和220環(huán)上位點(diǎn)發(fā)生變異,從2012年開始,毒株相對(duì)疫苗株出現(xiàn)了較大的變異,氨基酸位點(diǎn)的變異個(gè)數(shù)均超過(guò)10個(gè)。福建省近年來(lái)的甲流毒株已經(jīng)出現(xiàn)了抗原漂移現(xiàn)象??乖浦昱c非抗原漂移株在NA基因第34、4
5、4、200、241、321、369、386和432位點(diǎn)上的變異存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。
4、在本次甲流毒株中發(fā)現(xiàn)了D222G和Q293H位點(diǎn)的突變,但并未增強(qiáng)病毒毒力,所有毒株均表現(xiàn)為低致病性。
5、本次研究中發(fā)現(xiàn)了“達(dá)菲”耐藥位點(diǎn) H275Y,并伴有可能會(huì)增強(qiáng) H275Y突變株NA酶活性及蛋白表達(dá)的V241I和N369K的同時(shí)突變。
6、有3個(gè)毒株的HA蛋白上均增加一個(gè)位于抗原決定簇Sa內(nèi)的糖基化位點(diǎn)NKS162
6、-164或NQS162-164,其中2個(gè)毒株源于暴發(fā)疫情。在毒株中發(fā)現(xiàn)可能與耐藥相關(guān)的NA上的糖基化位點(diǎn) NQS42-44的增加,在毒株A/Fujianfuzhou/SWL11724/2009(H1N1)上也發(fā)現(xiàn)了可能會(huì)影響病毒的組織嗜性尤其是神經(jīng)嗜性的NA蛋白的NGT146-148位點(diǎn)的缺失。
結(jié)論:
福建省甲流病毒已悄然發(fā)生遺傳變異和分子進(jìn)化,與疫苗的同源性隨著時(shí)間的推移逐漸降低,并出現(xiàn)了51株抗原漂移株,且在N
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