蛋白糖基化分析新方法研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、糖基化是真核細胞蛋白質(zhì)最常見的轉(zhuǎn)譯后修飾方式之一,連接在天冬酰胺上的稱為N-糖鏈,連接在絲氨酸或者蘇氨酸上的稱為O-糖鏈。蛋白糖基化在許多生命活動中起重要作用,包括蛋白質(zhì)折疊、細胞識別、癌細胞增殖、免疫反應(yīng)等。蛋白N糖基化分析有很多方法。最簡單的方法是酶解釋放N糖鏈后直接進行MS質(zhì)譜分析。Peptide-N-glycosidase F(PNGase F)是一種用來從蛋白或多肽上酶解沒有取代的或6位巖藻糖取代的N糖鏈的酶,現(xiàn)廣泛應(yīng)用于哺乳

2、動物的N糖基化研究中。一些進一步的研究就建立在這些釋放下來的N糖鏈上。更常見的情況下,是將N糖鏈釋放后進行衍生化以改善其分離度和增強檢測靈敏度。
  本研究建立了一種新的 N糖基化的分析方法,其中優(yōu)化了去糖基化的反應(yīng)條件和試劑,以加快 N糖鏈的釋放速度,并采用了一種能夠同時提高分離度和熒光、質(zhì)譜響應(yīng)靈敏度的新型標(biāo)記試劑(Rap iF luor-MS)來標(biāo)記釋放下來的糖鏈。此外,為了簡化數(shù)據(jù)分析難度,我們還建立了一個虛擬的N糖鏈數(shù)據(jù)

3、庫,使得復(fù)雜的N糖鏈數(shù)據(jù)能夠被自動、精確有效地識別和歸屬。最終形成一套簡單、快速、靈敏、高效的N糖基化分析方法,并將其成功應(yīng)用到了復(fù)雜糖蛋白和癌細胞表面N糖基化分析中。另外,由于目前沒有廣譜O-糖基解離酶,我們初步建立了一種有效的O-糖鏈分析方法。該方法采用了高能碰撞解離產(chǎn)物離子相關(guān)電子轉(zhuǎn)移解離(HCD-pd-ETD)二級質(zhì)譜模式對廣譜蛋白酶降解得到的糖肽進行分析,并對數(shù)據(jù)采用較新的 Byo nic軟件進行了分析,這種方法可以同時得到

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