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文檔簡介
1、目的:
椎間盤的老化和退變是脊柱退變性疾病發(fā)生的前提條件和病理基礎(chǔ),理解椎間盤老化和退變的生物學(xué)機(jī)制,開發(fā)有效的治療干預(yù)措施以應(yīng)對椎間盤退變帶來的健康問題已經(jīng)成為當(dāng)前和未來全球性醫(yī)學(xué)難題之一。本研究通過生物信息學(xué)分析篩選髓核細(xì)胞凋亡調(diào)控相關(guān)的lncRNA,進(jìn)而探索lncRNA在椎間盤退變過程中髓核細(xì)胞凋亡調(diào)控的分子機(jī)制,從而為尋找椎間盤退變性疾病治療的新靶點(diǎn)提供科學(xué)指導(dǎo)。
方法:
1、比較三種生物信息學(xué)分析
2、軟件,應(yīng)用TargetScan軟件篩選可能通過miR-155參與髓核細(xì)胞凋亡調(diào)控的lncRNA。2、RT-PCR檢測髓核細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-155mimics后lncRNA表達(dá)調(diào)控情況,通過lncRNA及mRNA芯片檢測評估髓核細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-155過表達(dá)慢病毒后lncRNA及mRNA表達(dá)譜變化,評估m(xù)iR-155作為基因治療靶點(diǎn)可能對髓核細(xì)胞功能產(chǎn)生的影響。3、流式細(xì)胞分析檢測過表達(dá)GAS5 lncRNA后髓核細(xì)胞的凋亡情況,Wester
3、n Blot檢測線粒體通路上兩個(gè)關(guān)鍵凋亡相關(guān)蛋白Caspase-3和Bcl-2的表達(dá),驗(yàn)證GAS5 lncRNA對髓核細(xì)胞凋亡調(diào)控的影響,探索GAS lncRNA參與髓核細(xì)胞凋亡調(diào)控的可能機(jī)制。
結(jié)果:
1、退變椎間盤髓核組織內(nèi)共有631個(gè)表達(dá)上調(diào)的lncRNA序列信息較為明確,其中有148個(gè)上調(diào)的lncRNA包含了178個(gè)hsa-miR-155-5p結(jié)合位點(diǎn)。符合TargetScan評分標(biāo)準(zhǔn)的lncRNA有16個(gè),
4、NR_002819含有6個(gè)hsa-miR-155-5p結(jié)合位點(diǎn),ENST00000511037、NR_027451包含了5個(gè)結(jié)合位點(diǎn),19個(gè)lncRNA包含了2個(gè)結(jié)合位點(diǎn),126個(gè)lncRNA包含了1個(gè)結(jié)合位點(diǎn)。2、GAS5 lncRNA包含了1個(gè)hsa-miR-155-5p結(jié)合位點(diǎn),外源性導(dǎo)入hsa-miR-155 mimics72小時(shí)后,髓核細(xì)胞GAS5 lncRNA表達(dá)較陰性對照組明顯下降(P<0.05)。lncRNA及mRNA表
5、達(dá)譜芯片分析共發(fā)現(xiàn)721個(gè)差異表達(dá)lncRNA(Fc值≥2,P<0.05),其中492個(gè)lncRNA表達(dá)上調(diào),229個(gè)lncRNA表達(dá)下調(diào)。芯片檢測的18個(gè)GAS5 lncRNA轉(zhuǎn)錄本均表達(dá)下調(diào),僅有GAS5-021表達(dá)具有顯著差異(Fc值≥1.5,P<0.05)。Gene Ontology分析顯示,髓核細(xì)胞在miR-155過表達(dá)后基因表達(dá)發(fā)生了明顯的改變,主要集中在腫瘤、免疫性疾病、退變性疾病及心血管疾病等領(lǐng)域,其中以強(qiáng)直性脊柱炎及滑
6、膜炎與椎間盤的關(guān)系最為密切。3、GAS5 lncRNA過表達(dá)慢病毒轉(zhuǎn)染96小時(shí)后,髓核細(xì)胞GAS5 lncRNA的表達(dá)水平提高(P<0.05),凋亡蛋白酶Caspase-3表達(dá)上調(diào),凋亡抑制蛋白Bcl-2表達(dá)下調(diào),髓核細(xì)胞的凋亡率較陰性對照組明顯升高(P<0.05)。
結(jié)論:
lncRNA在退變椎間盤髓核細(xì)胞凋亡調(diào)控中起到了重要作用,GAS5 lncRNA過表達(dá)使得髓核細(xì)胞內(nèi)線粒體凋亡通路上的兩個(gè)關(guān)鍵蛋白家族成員的表
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