廣東部分地區(qū)FMDV血清學(xué)調(diào)查及FMDV VP1基因分析.pdf

1、口蹄疫（FMD）是由口蹄疫病毒（FMDV）引起的主要侵害偶蹄動物的一種高度接觸性人畜共患病，該病在全世界持續(xù)的流行對養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟損失。
　　為了解近幾年口蹄疫在廣東省的流行情況，本研究對2013年-2014年廣東省部分豬群的血清進行了口蹄疫抗體檢測，結(jié)果表明：2013年口蹄疫抗體陽性率為81.61％（2662/3262，95%CI：80.23%-82.92%）；2014年口蹄疫抗體陽性率為91.88%（2704/2943

2、，95%CI：90.83%-92.84%）。近2年抗體檢測發(fā)現(xiàn)口蹄疫抗體陽性率有所上升。
　　為了了解近幾年口蹄疫病毒VP1基因的遺傳變異情況，將采集廣東省散養(yǎng)或圈養(yǎng)豬17份疑似病料，經(jīng)RT-PCR檢測及VP1基因序列分析，結(jié)果表明這些樣品均為O型口蹄疫。17個毒株與O/BY/CHA/2010株的同源性最高，同源率在94.2%~97.2%之間。對VP1基因的核苷酸序列遺傳進化樹進行分析，結(jié)果表明，這17個毒株與和當前廣東最主要的流

3、行O/BY/CHA/2010株，在ES-SA分支上，屬耿馬譜系。對VP1氨基酸位點變異性進行分析，結(jié)果表明，VP1基因的高突變區(qū)是在23位~27位、45位~58位、135位~145位、149位~159位。通過Z曲線理論對FMDV的研究，結(jié)果表明，每亞型病毒都有自己獨有的Z曲線。通過對毒株Ka/Ks分子進化分析，結(jié)果表明：本實驗分離的17毒株具有純化選擇作用。通過對FMDV密碼子使用相對概率進行分析，結(jié)果表明：隨著進化壓力的選擇，Gly、

4、Arg、Ser最優(yōu)密碼子發(fā)生變化。通過對同義密碼子不同位置GC含量相關(guān)性分析，結(jié)果表明，GC1與GC2、GC3、GC12、Gcall和ENC之間呈極顯著相關(guān)性；GC2與Gcall極顯著相關(guān)性，與GC3和GC12顯著相關(guān)性，與ENC不相關(guān)；GC3與GC12、Gcall和ENC之間呈極顯著相關(guān)性；ENC與GC12呈顯著相關(guān)性。通過對ENC與GC3的相關(guān)性進行分析，結(jié)果表明：S-GDHZ-03-2014株僅受選擇的影響；S-GDDW-2013