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文檔簡介
1、目的:建立LDLR基因rs688、ApoB基因rs693和ApoC-Ⅰ基因rs4420638單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-高分辨率熔解曲線(PCR-HRM)的檢測方法,并探討上述位點(diǎn)與冠心?。–HD)易感和血脂水平的相關(guān)性。
方法:針對rs688、rs693和rs4420638位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)引物,建立PCR-HRM分子診斷方法,并通過直接測序進(jìn)行驗(yàn)證;運(yùn)用上述建立的PCR-HRM檢測方法對rs688、rs693和
2、rs4420638位點(diǎn)進(jìn)行基因分型;通過病例-對照研究(其中CHD組311例、健康對照組300例)探討上述位點(diǎn)與CHD的易感性;以462例蘭州地區(qū)漢族人群為研究對象,分析上述位點(diǎn)與血脂水平的關(guān)系。
結(jié)果:⑴PCR-HRM檢測方法的建立:本研究基于HRM技術(shù)建立了rs693、rs688和rs4420638位點(diǎn)的PCR-HRM檢測方法,并成功地檢測了1073例臨床標(biāo)本(CHD組311例、健康對照組300例、血脂研究組462例),從
3、而實(shí)現(xiàn)了其基因多態(tài)性的快速檢測。⑵CHD易感性分析:健康對照組 rs688、rs693和rs4420638位點(diǎn)均達(dá)到Hardy-Weinberg平衡(?2值分別為3.055、2.804、1.151。P>0.05);rs693和rs4420638位點(diǎn)的基因頻率和基因型頻率在CHD組與對照組之間的分布差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(rs693:2=8.167,P=0.004;2=8.836,P=0.003;rs4420638:2=8.664,P=0.0
4、03;2=9.512,P=0.002);在加性模型下,并調(diào)整性別、年齡、BMI后,對rs693、rs4420638和rs688位點(diǎn)進(jìn)行多元Logistic回歸分析發(fā)現(xiàn),rs693和rs4420638位點(diǎn)基因多態(tài)性與蘭州地區(qū)漢族人CHD易感性相關(guān)。與rs693 CC基因型相比,rs693CT基因型個體患CHD的風(fēng)險(xiǎn)下降(OR=0.448,95%CI:0.246~0.817,P=0.009);與rs4420638 AA基因型相比,rs442
5、0638 AG基因型的個體患CHD的風(fēng)險(xiǎn)增加(OR=2.140,95%CI:1.241~3.688,P=0.006);rs688(C>T)和rs4420638(A>G)位點(diǎn)組成的單倍型CG增加CHD的患病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.715,95% CI:1.091~2.697,P=0.018)。⑶血脂水平關(guān)聯(lián)性分析:經(jīng)單因素方差分析發(fā)現(xiàn),rs688位點(diǎn)各基因型之間的TC、LDL-C水平差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);rs693位點(diǎn)各基因型之間的
6、TC、TG水平差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);rs4420638位點(diǎn)各基因型之間的TG水平差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);在顯性模型下,分別以TC、TG、LDL-C、HDL-C為因變量,以性別、年齡、BMI、rs688、rs693、rs4420638為自變量進(jìn)行多元線性回歸分析發(fā)現(xiàn),rs688 T等位基因攜帶者的TC、LDL-C水平高于CC純合型(β=0.301,P<0.001;β=0.335,P<0.001);rs693T等位
7、基因攜帶者的TC、TG水平低于CC純合型(β=-0.250,P=0.027;β=-0.162,P=0.029);rs4420638G等位基因攜帶者的TG水平顯著高于AA純合型(β=0.180,P=0.016)。
結(jié)論:成功建立了rs693、rs688和rs4420638位點(diǎn)的PCR-HRM基因分型方法;rs693和rs4420638位點(diǎn)以及單倍型CG與蘭州地區(qū)漢族人群CHD易感性有關(guān);rs693、rs688和rs4420638
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