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文檔簡介
1、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文刺槐、黃檀、合歡根瘤菌的多相分類及系統(tǒng)發(fā)育研究姓名:陳文峰申請學(xué)位級別:博士專業(yè):微生物學(xué)指導(dǎo)教師:陳文新2002.5.1ABSTRACTThisthesisreviewedthehistoricaldevelopment,thecurrenttaxonomicstatusandthephylogenyofrhizobiaandcomparedthemainmethodsappliedinrhizobiaipol
2、yphasictaxonomyRhizobiaisolatedfromtreeleguminousDalbergiaspp,Robiniapseudoacacia,AlbiziasppinvariousgeographicalregionsofChinawerestudiedtogetherwiththereferencestrainsofsomerecognizedrhizobialspeciesbyperformingpolypha
3、sictaxonomyincludingnumericaltaxonomy16SrDNAPCRRFLPBOXPCRfingerprinting,AFLPfingerprinting,DNAbasecompositionandDNADNAhybridization7hPresultsof129phenotypiccharacteristicsshowedthatmoststrainscouldgrowon7刪with5I_tg/ml,ev
4、en300I_tg/mlantibioticsNineteenstrainsCallgrowonYM【Awithpill20EightstrainsgrowwellOnYMAatthetemperatureof40℃Fivegroupscouldbeclusteredatthesimilarity1evelof85%onthebasisofnumericaItaxonomyGroup1,2,3and5eachconsistedofone
5、ortwoknownreferencestrains;howevergroup4,whichmaybeanewtaxon,didn’tcontainanyknownreferencestrainsTheanalysisof16SrDNAPCRRFLPdescribed30differentgenotypiccharacteristicsand7phylogeneficbranchesThedendrogramderivedfromPCR
6、RFLPof16SrDNAshowedthattheclustemofabove86%ofstrainsagreedwiththatofnumericalanalysisofphenotypiccharacteristiCSBOXPCRfingerprintingismoreappropriateusingasamethodrevealinggenotypicdiversitywithinarhizobialspeciesTheflng
7、erprintingsofsomehighlyrelatedstrainswereidenticalandgroupedwithinonegroupMostofreferencestrainsincludingonerecognizedrhizobialspecieswerenotgroupedtogetherSixgroupsobtainedfromAFLPfingerprintingatthesimilaritylevelof78%
8、Eachgroupcorrelatedwellwiththeresultsofnumericaltaxonomyand16SrDNAPCRRFLPwithexceptionofsomelittledifferencesThecongruenceoftheresultsbetweengeneticsandphenotypesmcmrl5thatAFLPfingerprintingisabettermethodforidentificati
9、onandgroupingofrhizobialspeciesSequencesof16SrDNAoffourstrainswereanaiysizedforthestudyofphylogeneficsCCBAU41044andCCBAU25087wereclusteredwithinthephylogeneticbranchofRhizobium,theotherstrainsCCBAU25126andCCBAU23046,were
10、intheMesorhizobiumandBradyrhizobium,respectively111cDNAGCmol%contentsofthefourstrainsCCBAU41044,CCBAU25087,CCBAU25126,CCBAU23046wele566,568,608,623(砌),respectivelyTheDNAhomologybetweenCCBAU25087andtheotherstrainsinthesam
11、egroup4ofnumericaltaxonomyWSSabove70%111chomologybetweenCCBAU25087andtheknownmferences訂ainsofRhizobiumwaslowerthan70%,thisindicatedthatgroup4WasanewDNArelatednessgroupdifferentfromknownrhizobiaspeciesKeywords:rhizobiatax
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