基于文昌魚（Branchiostoma floridae）ESTs的轉(zhuǎn)錄組比較分析及EST數(shù)據(jù)庫構(gòu)建.pdf

1、r1106474分類號密數(shù)單位代碼：1Q3笪學(xué)號：SQ4Q21Q!122名微虐業(yè)太虧學(xué)位論文基于文昌魚(Branchiostomafloridae)ESTs的轉(zhuǎn)錄組比較分析及EST數(shù)據(jù)庫構(gòu)建Transcriptome—wideComparativeAnalysesbasedonAmphioxus(Branchiostomafloridae)ESTsandItsESTDatabase研究指導(dǎo)教師：王苤宣教援合作指導(dǎo)教師：呈]數(shù)援專業(yè)領(lǐng)域名

2、稱：生塑塑理研究方向：生塹信。墾堂答辯委員會主席：2007年6月6在特定C、P、F功能的不同發(fā)育階段，其階段持續(xù)性表達(dá)水平大小依次為C、F、P，而階段特異性表達(dá)水平大小則為F、P、C，但在成體期其表達(dá)水平為C、F、P表達(dá)量依次增高。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)：在與細(xì)胞組件相關(guān)的功能特異性表達(dá)方面，幼體期的特異性表達(dá)量最高；在與分子功能活性相關(guān)的功能特異性表達(dá)中，神經(jīng)胚時期的特異性表達(dá)量最高；面參與生物過程的功能特異性表達(dá)方面，神經(jīng)胚時期的特異性表達(dá)

3、量則最高。7不同物種間轉(zhuǎn)錄組分析顯示尾索動物海鞘的轉(zhuǎn)錄組與棘皮動物海膽的最接近，其相關(guān)系數(shù)為O896，而海膽與文昌魚的相關(guān)系數(shù)只有O682，結(jié)果表明在進(jìn)化上文昌魚可能與脊椎動物更接近。8運(yùn)用Apache、php、MysQL技術(shù)搭建了Widows平臺的文昌魚EST分析數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)庫中收錄了原始的277538條EST數(shù)據(jù)，收錄了文昌魚轉(zhuǎn)錄層次各方面的數(shù)據(jù)和結(jié)果(http：／／amphioxustrmueducn／homepagephp)。上