虎紋蛙mtDNA全序列分析及其分類地位研究.pdf

1、動(dòng)物的線粒體基因組具有結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單穩(wěn)定、進(jìn)化速率快、母系遺傳、幾乎不發(fā)生重組等特點(diǎn),因此目前是用來研究基因結(jié)構(gòu)、功能等的熱點(diǎn)。本研究為國(guó)家自然基金研究項(xiàng)目的部分環(huán)節(jié),首次對(duì)虎紋蛙線粒體基因組全序列進(jìn)行測(cè)定與多方面的分析,為進(jìn)一步探討蛙科、蛙類或更高級(jí)的階元間系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系具有重要意義。
　　本論文從線粒體基因組和分類地位等兩個(gè)方面對(duì)虎紋蛙進(jìn)行研究。
　　1虎紋蛙(Hoplobatrachus rugulosus)是Wiegmann

2、于1835年命名并歸于蛙屬的,費(fèi)梁將其單獨(dú)劃分為虎紋蛙屬(Hoplobatrachus),這個(gè)學(xué)名為目前大部分學(xué)者所接受。第一章對(duì)虎紋蛙到目前為止的研究概況與進(jìn)展、線粒體基因組的特點(diǎn)以及選取線粒體基因組作為研究對(duì)象的原因、意義等方面進(jìn)行綜述。
　　2通過常規(guī)PCR與2步PCR法,測(cè)定了采自廣西的虎紋蛙標(biāo)本線粒體基因組全序列,全長(zhǎng)共16905bp,包括13個(gè)蛋白編碼基因(COⅠ~Ⅲ、ND1～6和ND4L、Cytb、ATP8、ATP6

3、),22個(gè)tRNA,2個(gè)rRNA基因(12S rRNA、16S rRNA)和一個(gè)非編碼區(qū)。除此之外,它還具有以下幾個(gè)特殊之處:1)一個(gè)tRNAMet拷貝基因;2)tRNALeu(CUN)可能在移位時(shí)消失;3)ND5的特殊基因順序;4)兩個(gè)重排的tRNA基因(tRNAThr,tRNAPro)。我們分析了基因組的堿基與氨基酸組成,并首次對(duì)兩棲類蛙科動(dòng)物的非編碼區(qū)進(jìn)行綜合研究,例如其一般結(jié)構(gòu)、保守區(qū)域等;探討了ND5的重排等,根據(jù)上述特點(diǎn),認(rèn)

4、為將虎紋蛙從蛙屬中劃分出來的觀點(diǎn)是合理的。
　　3根據(jù)對(duì)虎紋蛙與近緣種的16S rRNA進(jìn)行序列與空間結(jié)構(gòu)分析。以東方鈴蟾作為外群,構(gòu)建系統(tǒng)樹,可以看出虎紋蛙與福建大頭娃為一組,并與其它四種構(gòu)成姐妹群。但總體上并未形成明顯的系統(tǒng)地理結(jié)構(gòu)。按照空間結(jié)構(gòu)的平面圓圈圖,推測(cè)出它們的結(jié)構(gòu)功能單位,對(duì)于以后的系統(tǒng)發(fā)育學(xué)具有較高的參考價(jià)值。
　　4由ND5的重排與tRNAMet拷貝基因我們綜合比較了兩棲類一些代表物種的mtDNA順序。根