中國西南馬mtDNA序列進(jìn)化與群體遺傳結(jié)構(gòu)分析.pdf

1、本研究從中國貴州黔西南州冊亨縣、廣西百色德保地區(qū)、云南丘北縣、大理、文山州和陜西寧強(qiáng)地區(qū)等省、市地區(qū)采集了貴州馬(GZ，30匹)、德保馬(DB，34匹)、丘北馬(YN，30匹)、文山馬(WS，18匹)、大理馬(DL，10匹)、寧強(qiáng)馬(NQ，20匹)、建昌馬(LC，2匹)七個西南馬品種，并在山東濟(jì)南動物園采集到了外來純種設(shè)特蘭矮馬(ST，3匹)作為對照。共計(jì)147個馬品種的樣品，基于PCR-SSCP和DNA測序技術(shù)，利用自行設(shè)計(jì)的3對引物

2、(MT2、MT3、MT5)和參照Stephen Paul Harrison等(2006)[50]的兩對引物(MT1、MT4)對以上馬品種線粒體DNA編碼區(qū)進(jìn)行多態(tài)性分析，從而進(jìn)一步探討了群體內(nèi)和群體間的mtDNA的遺傳變異，目的是為了西南馬遺傳資源的合理利用及保護(hù)提供科學(xué)的依據(jù)。研究結(jié)果如下: 1.五對引物中，只有三對引物擴(kuò)增片段出現(xiàn)多態(tài)性。MT2、MT4多態(tài)位點(diǎn)上存在兩種單倍型(即A和B)，而且B單倍型出現(xiàn)頻率均高于A單倍型；

3、在MT3位點(diǎn)上，共檢測到四種單倍型，其中A單倍型占優(yōu)勢。 2.所測序的線粒體ND4和ND4L基因的部分核苷酸序列平均GC含量在74.3％～47.1％之間，核苷酸組成偏倚不嚴(yán)重，但密碼子使用存在偏倚。 3.西南馬品種內(nèi)核苷酸多樣性(Pi)較高(0.00467～0.00737)，其中大理馬的核苷酸多樣性(Pi)最低，為0.00467，貴州馬、德保馬、文山馬和寧強(qiáng)馬均為0.00649，丘北馬最高，為0.00737。各品種間的遺