安徽琴魚的形態(tài)學鑒別和線粒體DNA的系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、琴魚（Rhinogobius SP）屬于鱸形目（Perciformes）蝦虎魚亞目(Gobioidei)蝦虎魚科(Gobiidae)吻蝦虎魚屬(Rhinogobius)，是安徽省皖南山區(qū)地方特有魚類，也是安徽省二級保護動物，具有極高的經(jīng)濟價值。目前琴魚的種屬關系只鑒定至吻蝦虎魚屬。由于蝦虎魚體型較小，且種類繁多，其游泳能力不強，許多種類由于地理隔絕等因素形成了新種或亞種，造成了蝦虎魚的分類較為混亂。本文主要從形態(tài)學和分子分類學兩個方面對

2、琴魚的種屬關系進行鑒定和分析，得到以下結(jié)論:
　　一、琴魚外形細長，前端呈圓柱狀，后部呈側(cè)扁形，雌魚體長和體寬的比例較雄魚略小，且體色比雄魚淺，體被大櫛鱗，頭部無鱗、腹部無鱗，無背鰭前鱗，無側(cè)線，胸鰭透明無色，基部無黑色斑點，展開呈圓形，與琴魚形態(tài)學特征最為相似的是褐吻蝦虎魚和波氏吻蝦虎魚，但波氏吻蝦虎魚的胸鰭鰭條數(shù)比琴魚多2-3條，且第一背鰭上有一藍黑色斑，而褐吻蝦虎魚第一背鰭高聳呈三角形。
　　二、通過PCR擴增得到琴魚

3、線粒體基因組全長，通過序列分析，得到結(jié)論如下:琴魚線粒體基因組全長16483bp（登錄號:KU871066.1），堿基組成為:A(27.06％)、T(26.21％)、G(16.89％)、C(29.84％)其中G的含量相對較少，A、T、C堿基數(shù)量基本相當，并且A+T堿基(53.27％)大于G+C堿基(46.73％)。包括37個編碼基因和一個非編碼控制區(qū)（D-loop區(qū)），編碼基因包括13個蛋白質(zhì)基因、2個rRNA基因，22個tRNA基因，

4、其中tRNA基因中的Gln、Ala、Asn、Cys、Tyr、Ser、Glu、Pro基因在L鏈上編碼，剩余的基因均編碼在H鏈上。最長的非編碼區(qū)位于Asn和Cys之間，共有27bp，重復編碼區(qū)域均不超過10bp，最多為7bp。
　　三、采用了鄰接法和最大似然法兩種方法分別對16S rRNA、ND1、ND2、COXⅠ和Cyt b基因建立系統(tǒng)進化樹。結(jié)果顯示，兩種方法分別針對上述基因建立的進化樹都明確地將琴魚歸類至吻蝦虎魚屬，支持形態(tài)學上

5、的分類結(jié)果。鄰接法構(gòu)建的進化樹中，除ND2基因建立的進化樹將子陵吻蝦虎魚歸類于裸頭蝦虎魚屬外，其他4個進化樹都將吻蝦虎魚聚在一起，但屬內(nèi)種之間的親緣關系不完全相同，且屬以上層次的親緣關系差異較大。
　　最大似然法建樹，除ND2基因建立的進化樹將子陵吻蝦虎魚歸類于裸頭蝦虎魚屬外，其他4個進化樹都將吻蝦虎魚聚在一起。16S rRNA和COXⅠ進化樹中，與吻蝦虎魚屬親緣關系最近的是矛尾蝦虎魚屬（Chaemrichthys）和鈍尾蝦虎魚屬

6、(Amblychaeturichthys)，ND1進化樹中與吻蝦虎魚屬較為接近的是線塘鱧屬（Nemateleotris），ND2進化樹中與之親緣關系最接近的屬是縞蝦虎虎魚屬（trigonocephalus），Cytb進化樹中與吻蝦虎魚屬親緣關系較為接近的是短蝦虎魚屬（Brachygobius）。
　　四、琴魚和吻蝦虎魚的3個種以及虎魚屬的三個種遺傳距離比較。在16SrRNA基因遺傳距離明顯小于其他基因，ND1和ND2進化速度較快，

7、COX1和Cyt b較為保守，全序列的進化速度和Cyt b基因最為接近。與琴魚遺傳距離最短的為褐吻蝦虎魚，Mt DNA的遺傳距離接近0.095;其次是波氏吻蝦虎魚，遺傳距離為0.113。
　　綜合形態(tài)學特征和分子分類學分析結(jié)果，認定琴魚為吻蝦虎魚一地方亞種，是否為新種還需進一步研究鑒定。
　　本文通過形態(tài)學和分子水平兩個方面，準確鑒定出琴魚的種屬關系，為開發(fā)和保護琴魚資源提供理論基礎;同時獲得了琴魚線粒體基因組全長，補充了G