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1、幾丁質(zhì)是由N-乙酰-D-葡萄糖胺通過β-1,4糖苷鍵連接的高聚多糖,是構(gòu)成昆蟲表皮的主要成分。幾丁質(zhì)脫乙?;?(CDA1)能夠催化幾丁質(zhì)產(chǎn)生氨基和乙酸,對(duì)昆蟲的表皮的幾丁質(zhì)進(jìn)行修飾,是潛在的農(nóng)藥靶標(biāo)。雖然人們通過 RNA干擾確定了 CDA1的功能缺失會(huì)導(dǎo)致昆蟲蛻皮不正常而死亡,但對(duì)其生化性質(zhì)卻知之甚少。課題組前期重組表達(dá)了全長(zhǎng)家蠶CDA1和CDA7蛋白。本論文工作主要包括重組表達(dá)家蠶幾丁質(zhì)脫乙?;?的催化域(BmCDA1-CAD),
2、對(duì)其進(jìn)行結(jié)晶條件篩選,并研究了全長(zhǎng)BmCDA1和催化域的底物結(jié)合活性及催化活性。另外,也探索了利用大腸桿菌制備亞洲玉米螟CDA1(OfCDA1)雙鏈RNA的方法。
本論文研究工作主要包括:
?。?)構(gòu)建了表達(dá)載體pPIC9-BmCDA1-CAD,在畢赤酵母中得到了BmCDA1-CAD的重組表達(dá),產(chǎn)量為5 mg/L。發(fā)酵液經(jīng)硫酸銨富集后,采用金屬螯合層析分離純化,經(jīng)SDS-PAGE電泳和Western Blot驗(yàn)證得到電
3、泳純的目的蛋白,其實(shí)際分子量約為50 kD。
?。?)利用Hampton Research公司的晶體試劑盒進(jìn)行了BmCDA1-CAD的結(jié)晶條件篩選。蛋白質(zhì)的緩沖液為20 mM Bis-Tris,10 mM NaCl,pH7.0。初步篩選400個(gè)條件得到晶體能夠生長(zhǎng)的條件,即0.2 M硫酸銨,0.1 M BIS-TRIS pH6.5,25%w/v聚乙二醇3350。之后通過調(diào)整蛋白濃度,pH值及沉淀劑濃度優(yōu)化了363個(gè)結(jié)晶條件,最終
4、確定適于BmCDA1-CAD晶體的生長(zhǎng)條件為:蛋白濃度為12 mg/ml,結(jié)晶緩沖液為0.2 M硫酸銨,0.1 M BIS-TRIS pH6.8,27%w/v聚乙二醇3350。
?。?)通過對(duì)比陰性對(duì)照BSA發(fā)現(xiàn),對(duì)于α-幾丁質(zhì)底物,全長(zhǎng)BmCDA1的特異性結(jié)合能力(40%)強(qiáng)于BmCDA1-CAD(33%);對(duì)于β-幾丁質(zhì)底物,全長(zhǎng)BmCDA1的特異性結(jié)合能力(53%)強(qiáng)于BmCDA1-CAD(32%);對(duì)于膠體幾丁質(zhì)底物,全
5、長(zhǎng)BmCDA1(27%)有特異性結(jié)合,但是 BmCDA1-CAD(17%)沒有特異性結(jié)合;對(duì)于殼聚糖底物,全長(zhǎng)BmCDA1(16%)和BmCDA1-CAD(12%)都沒有特異性結(jié)合。
?。?)課題組前期工作證明了利用熒光胺法、MBTH法和對(duì)硝基乙酰苯胺法(基于檢測(cè)游離氨基的生成)無法檢測(cè)到BmCDA7和全長(zhǎng)BmCDA1的催化活性。因此,建立一種新的基于游離乙酸檢測(cè)的方法。以65%乙?;瘹ぞ厶菫榈孜铮訡lCDA為陽(yáng)性對(duì)照,利用微
6、量乙酸檢測(cè)試劑盒,成功檢測(cè)到BmCDA7的脫乙?;钚?,但是全長(zhǎng)BmCDA1和催化域未檢測(cè)到催化活性。序列分析發(fā)現(xiàn)BmCDA7和BmCDA1-CAD的相似性為36%,均有催化所必須的氨基酸。同源建模發(fā)現(xiàn)BmCDA1-CAD有一個(gè)較長(zhǎng)柔性LOOP掩蓋催化口袋,推測(cè)此結(jié)構(gòu)導(dǎo)致催化活性差異。因此將 BmCDA1-CAD的長(zhǎng) LOOP替換為BmCDA7的短LOOP。構(gòu)建重組質(zhì)粒pPIC9-BmCAD1/7,并將其電轉(zhuǎn)獲得重組表達(dá)菌株。通過Wes
7、tern Blot驗(yàn)證,目的蛋白BmCAD1/7得到了誘導(dǎo)表達(dá)。需要進(jìn)一步優(yōu)化發(fā)酵和分離條件,得到純蛋白以探究LOOP結(jié)構(gòu)對(duì)催化活性的影響。
?。?)構(gòu)建dsRNA的表達(dá)載體L4440-OfCDA1,L4440-OfEcR,L4440-GFP,將其轉(zhuǎn)化至大腸桿菌HT115中實(shí)現(xiàn)高效表達(dá),產(chǎn)量分別為3 g/L,0.15 g/L和0.12 g/L。研究結(jié)果表明使用IPTG誘導(dǎo)產(chǎn)生dsRNA的最佳菌液濃度為OD600=0.3;dsRN
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