Goldenhar綜合征家系收集、表型分析和遺傳學(xué)研究.pdf

1、目的：分析Goldenhar綜合征的表型為該病的臨床診斷提供依據(jù)；收集Goldenhar患者的遺傳資料，為揭示此類疾病的遺傳基礎(chǔ)及發(fā)生機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
　　 方法：分析69例Goldenhar綜合征患者的臨床資料及表型間的相關(guān)性。采集一Goldenhar綜合征家系的全部成員及4組核心家系成員的的新鮮血液，試劑盒提取全基因組DNA。
　　 結(jié)果：69例患者中，絕大多數(shù)為散發(fā)(91.3％)，男女患病機(jī)會均等；雙側(cè)受累39例(5

2、6.5％)，單側(cè)受累30例(43.5％，左14：右16)；耳前贅(88.4％)、眼球皮樣瘤(84.1％)和其它眼異常(52.2％)是主要癥狀，半側(cè)顏面短小與口面裂、頜發(fā)育不良、除耳廓畸形及耳前贅外的其它耳異常呈正相關(guān)(p<0.05)，智力障礙與腦發(fā)育不良、視力減退、語言障礙、除耳廓畸形及耳前贅外的其它耳異常成明顯正相關(guān)(p<0.01)。收集到一Goldenhar綜合征家系內(nèi)的4例患者及11例正常家系成員和4例散發(fā)患者及其父母的高質(zhì)量DN

3、A樣本。
　　 結(jié)論：Goldenhar綜合征表型復(fù)雜多樣，屬于相關(guān)發(fā)育領(lǐng)域的表型常伴發(fā)出現(xiàn)；雙側(cè)受累的患者往往癥狀更嚴(yán)重，累及更多器官系統(tǒng)的發(fā)育不良，需要接受更詳細(xì)的臨床檢查。收集了一Goldenhar綜合征家系及4組父母.患者核心家系的DNA，是國內(nèi)寶貴的遺傳資源，為揭示此類疾病的遺傳基礎(chǔ)及發(fā)生機(jī)制奠定了良好的基礎(chǔ)。
　　 目的：為探索Goldenhar綜合征的致病原因，篩查8例患者的SALL1和TCOF1基因突變情

4、況。
　　 方法：取8例患者及其父母和正常同胞的基因組DNA，PCR擴(kuò)增SALL1和TCOF1的全部外顯子及部分內(nèi)含子，用直接雙向測序、Blast比對進(jìn)行突變分析。
　　 結(jié)果：在SALL1基因中發(fā)現(xiàn)2個多態(tài)數(shù)據(jù)庫已報道的單核苷酸多態(tài)；在TCOF1基因中發(fā)現(xiàn)了7個序列變異，其中6個已被報道為多態(tài)，1個為新發(fā)現(xiàn)的內(nèi)含子突變。所有序列變異都存在于患者的正常親屬中，與疾病表型無共分離現(xiàn)象。
　　 結(jié)論：未發(fā)現(xiàn)此8例患者

5、在SALL1和TCOF1基因中的致病性突變，支持Goldenhar綜合征在遺傳基礎(chǔ)上是有別于TBS和TCS的一種獨立疾病。
　　 目的：分析Goldenhar綜合征患者的基因組拷貝數(shù)變異，尋找與該疾病相關(guān)的位點。
　　 方法：采用Human CNV370-Quadv3-0芯片對家系成員及4組父母-患者核心家系進(jìn)行拷貝數(shù)變異(Copy Number Variation,CNV)的基因分型研究，芯片掃描結(jié)果用BeadStud

6、io軟件進(jìn)行CNV分析，并對一個可能與患者表型相關(guān)的新發(fā)拷貝數(shù)變異進(jìn)行real-time PCR驗證。
　　 結(jié)果：CNV分析在三個散發(fā)患者中發(fā)現(xiàn)10個新發(fā)的拷貝數(shù)變異，綜合考慮DGV數(shù)據(jù)庫、27個正常對照樣本以及CNV區(qū)域的基因信息情況，推測其中分別位于5q13.2、1q31.1和8p23.1區(qū)域的CNV可能與對應(yīng)患者的表型相關(guān)，并用real-time PCR證實了5q13.2區(qū)域內(nèi)的CNV在患者GS1中的存在。家系內(nèi)CNV分

7、析發(fā)現(xiàn)153個CNVs，但患者和正常個體間在CNVs數(shù)量和大小方面都沒有明顯差異，未發(fā)現(xiàn)與患者表型相關(guān)的CNV。
　　 結(jié)論：通過CNV分析，發(fā)現(xiàn)位于5q13.2的單拷貝缺失、1q31.1的重復(fù)和8p23.1的單拷貝缺失可能分別與對應(yīng)患者的表型相關(guān)。在一Goldenhar綜合征家系的全基因組掃描數(shù)據(jù)中，沒有發(fā)現(xiàn)與患者表型共分離的拷貝數(shù)突變，可能即使在同一家族內(nèi)，其病因也是非常復(fù)雜的，要闡明此類疾病的遺傳基礎(chǔ)將是一個非常具有挑戰(zhàn)性