生物信息學(xué)技術(shù)克隆鱖魚rRNA基因家族的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究采用親緣生物法的生物信息學(xué)技術(shù),獲得(魚屯)魚rRNA重復(fù)基因家族全序列,根據(jù)該序列設(shè)計3對引物(P1/P2、P3/P4和P5/P6),以鱖魚基因組DNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將擴(kuò)增產(chǎn)物克隆到pUCm-T質(zhì)粒,測序.結(jié)果表明:鱖魚的3個rRNA基因克隆片段的核苷酸序列全長分別為3,321bp、2,873bp和1,502bp,將3個鱖魚rRNA基因片段拼接成整個rRNA重復(fù)基因家族,序列全長為7,139bp,其中18S、ITS1、

2、5.8S、ITS2和28S基因的大小分別為1,837bp、745bp、158bp、434bp和3,073bp.序列已提交給美國NCBI的GenBank,接受登記編號分別為AY452489、AY452490、AY452491、AY452492、AY452493、AY452494、AY452495.同時,將鱖魚rRNA重復(fù)基因家族序列與人、挪威鼠、鮑魚、羅非魚、鏡鯉和虹鱒之間的序列分別進(jìn)行同源性與進(jìn)化關(guān)系分析,發(fā)現(xiàn)18S、5.8S、28S、

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