魚類MIF和SOCS基因家族的分子克隆和進(jìn)化分析.pdf

1、運(yùn)用生物信息學(xué)等技術(shù)，首次成功地發(fā)現(xiàn)和克隆了魚類MIF基因以及SOCS基因家族的12個(gè)成員共55個(gè)基因，并進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育分析、分子起源研究以及基因的組織分布、差異表達(dá)和初步的功能鑒定。 第一篇建立了一套魚類免疫功能基因分析鑒定的生物信息學(xué)方法，包括數(shù)據(jù)庫(kù)利用、基因ORF和UTR預(yù)測(cè)、基因組序列錯(cuò)誤糾正等，并例舉了詳細(xì)的實(shí)例，開發(fā)了GeneMaper/TransSeq等具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的生物信息學(xué)軟件，為深入開展魚類免疫基因的分子

2、克隆、生物學(xué)功能和分子進(jìn)化等研究打下了方法學(xué)基礎(chǔ)。 第二篇進(jìn)在黑青斑河豚(Tetraodon，nigroviridis)斑馬魚(Danio rerio)紅鰭東方魚屯(Fugu rubripes)，底鯔(Fundulus heteroclims)，，虹鱒(Oncorhynchus mykiss)鯰魚(Ictalurus punctams、)，鮭魚(Salmo salar)和大唇樸麗魚(Haplochromischilotes)等多

3、種魚類中，系統(tǒng)開展了MIF基因的分子克隆與進(jìn)化等研究，并分析MIF基因的拷貝數(shù)、組織分布和誘導(dǎo)表達(dá)規(guī)律，初步探討了其生物學(xué)功能。 第三篇首次從黑青斑河豚，斑馬魚，紅鰭東方鲀，三刺魚(Gasterosteusaculeatus)和青鳉(Oryzias latipes)等五種魚類中，系統(tǒng)分離鑒定了魚類SOCS基因家族12個(gè)成員共55個(gè)基因，其中SOCS3b，SOCS5b，SOCS8和SOCS9為SOCS家族新成員，迄今在包括哺乳動(dòng)物

4、在內(nèi)的所有物種中尚未見報(bào)道，極大豐富了SOCS家族研究的內(nèi)容，為發(fā)現(xiàn)SOCS家族新功能奠定了基礎(chǔ)。對(duì)SOCS基因家族的分子起源與進(jìn)化進(jìn)行了系統(tǒng)研究，發(fā)現(xiàn)了SOCS基因家族在脊椎動(dòng)物中的進(jìn)化規(guī)律，首次發(fā)現(xiàn)SOCS家族可以分為Type Ⅰ SOCS(包括SOCS4-7、SOCS和SOCS9)和Type Ⅱ SOCS(CISH，SOCS1-3,SOCS3b和SOCS8)兩類，并提出了脊椎動(dòng)物SOCS基因家族由兩個(gè)祖先分子通過(guò)內(nèi)含子缺失、基因復(fù)