禾本科植物中與非生物脅迫相關(guān)的aee、bam和hsf基因家族的比較和進化分析

1、目 錄符號說明?????????????????????????????1中文摘要?????????????????????????????2A B S T R A C T ．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5第1 章禾本科植物基因組進化的研究進展??????????????．．81 ．1 禾本科基因組???

2、?????????????????????91 ．2 禾本科植物的全基因組復制?????????????????．．1 01 ．3 禾本科植物基因家族的分子進化???????????????．．1 11 ．3 。1 基因家族物種特異性擴張機制???????????????1 21 ．3 ．2 基因家族成員功能分化??????????????????1 21 ．4 展望???????????????????????????．．1 3參考文

3、獻???????????????????????????1 4第2 章植物A E E 基因的起源、適應(yīng)性進化及在水稻中的非生物脅迫表達分析．．．．．???．．??．．．．??．．??．．．．?．．．．．．．．?．．．??．．?．．．．?．．??．．??．1 62 ．1 材料與方法????????????????????????．．1 92 ．1 ．1 序列數(shù)據(jù)來源??????????????????????．1 92 ．1 ．2 多序列

4、比對和構(gòu)建系統(tǒng)進化樹???????????????．1 92 ．1 - 3 正選擇作用檢測?????????????????????．1 92 ．1 ．4 水稻A E E 基因的表達分析?????????????????．2 02 ．2 結(jié)果????????????????????????????????????．．2 02 ．2 ．1 陸生植物A E E 基因????????????????????2 02 ．2 ．2 陸生植物A E

5、 E 基因的起源?????????????????2 42 ．2 ．3 陸生植物A E E 基因經(jīng)歷的選擇壓力?????????????2 62 ．2 ．4 水稻A E E 基因的非生物脅迫表達模式分析??????????2 92 ．3 討論????????????????????????????????????．．3 0參考文獻???????????????????????????3 24 ．1 ．6 ．4 第一鏈c D N A 合成

6、????????一I I I I I I I [ 1 1 1 1 1 1 1 [ 1 l l l I II I I I I l l lY 2 6 3 2 1 9 8 ．．．．．．．5 44 ．1 ．6 ．5 P C R 擴增??????????????????????????????5 54 ．1 ．6 ．6R e a l ．．t i m eP C R ．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．

7、．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5 54 ．2 結(jié)果與分析????????????????????????．．5 64 ．2 ．1 禾本科植物／／s f 基因系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系?????????????．5 64 ．2 ．2 H s f M 源基因簇的適應(yīng)性進化????????????????5 84 ．2 ．3 重復基因的適應(yīng)性進化??????????????????6 04 ．2 ．4 水稻

8、1 4 s f 基因在非生物脅迫下的表達譜分析?????????．6 04 ．2 ．5 玉米／4 s f 基因在非生物脅迫下的表達模式??????????．6 14 ．3 討{ 侖????????????????????????????????????．．6 4參考文獻???????????????????????????6 6附勇乏??．．．．．??．．．．．．．．??．．．?．?．．．．．??．．．．．??．．．．．?．．??．．。

9、???6 8附表1 禾本科植物B A J ／同源基因簇之間功能分化分析????????6 8附表2 “分枝一位點”特異性模型下五種禾本科植物雌因的正選擇作用檢測???????????????????????????????????????7 0附表3R E A L —T I M E P C R 中用到的引物??????????????．7 6附表45 種禾本科植物共1 2 3 個H S F 基因信息???????????7 8附表5 “

10、分枝一位點’’特異性模型下禾本科植物H S F 重復基因?qū)φx擇的檢鋇0 ????????????????????????????????????????．8 5附表6 不同非生物脅迫下水稻H S F 基因表達模式??????????9 1攻讀碩士期間發(fā)表的論文?????????????????????．9 2致{ 射．．．??．．．???．．．?．．．．．?．．．．．??．．?．．???．．?．．．?．．?．．．．．?．．?9 3揚州