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文檔簡介
1、本文以二酰胺吡啶修飾杯[4]芳烴,脂肪二羧酸及二者形成的主-客體復合物和杯[n]二吡咯及杯[n]二吡咯-鹵素陰離子復合物為研究對象,應(yīng)用分子力學、分子動力學和量子化學方法進行了計算研究,研究工作主要包括以下三個方面:1.采用分子力學/分子動力學模擬,對二酰胺吡啶修飾杯[4]芳烴與系列脂肪二羧酸的分子識別進行了研究。結(jié)果表明,不同鏈長的脂肪二酸與主體分子的酰胺基團以多氫鍵相結(jié)合,結(jié)合能力隨鏈長的增長而增加。進一步研究表明,動力學模擬計算的
2、平均結(jié)合能和根據(jù)動力學以及溶液動力學模擬得到的穩(wěn)定構(gòu)象所計算出的結(jié)合能均與實驗值吻合得更好。 2.應(yīng)用分子力學/分子動力學模擬,對杯[n]二吡咯和杯[n]二吡咯-鹵素陰離子復合物進行研究,為了比較,對杯[4]吡咯和杯[4]吡咯-鹵素陰離子復合物也做了同樣的研究。結(jié)果表明,鹵素陰離子與所有吡咯NH基團上的H原子形成氫鍵,同一主體分子,對鹵素陰離子的結(jié)合能力由F-到I-逐漸減弱;與杯[4]吡咯相比,杯[n]二吡咯對同一鹵素陰離子的結(jié)
3、合能力增強,真空動力學模擬和溶液動力學模擬表明模擬過程中主體分子,復合物構(gòu)象基本不變,保持穩(wěn)定構(gòu)象。 3.運用密度泛函B3LYP方法,對杯[4]二吡咯主體分子及其鹵素陰離子復合物進行了研究。結(jié)果表明,杯[4]二吡咯可與鹵素陰離子形成具有較高對稱性的復合物,其8個吡咯NH基團上的H原子均可以和鹵素陰離子形成氫鍵;杯[4]二吡咯與鹵素陰離子結(jié)合的順序為F->Cl->Br->I-。振動光譜、電荷分布以及前線軌道計算結(jié)果表明,杯[4]二
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