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1、2蛋白質(zhì)化學(xué)蛋白質(zhì)化學(xué)1用于測定蛋白質(zhì)多肽鏈N端、C端的常用方法有哪些?基本原理是什么?解答解答:(1)N末端測定法:常采用24―二硝基氟苯法、Edman降解法、丹磺酰氯法。①24―二硝基氟苯(DNFB或FDNB)法:多肽或蛋白質(zhì)的游離末端氨基與24―二硝基氟苯(24―DNFB)反應(yīng)(Sanger反應(yīng)),生成DNP―多肽或DNP―蛋白質(zhì)。由于DNFB與氨基形成的鍵對(duì)酸水解遠(yuǎn)比肽鍵穩(wěn)定,因此DNP―多肽經(jīng)酸水解后,只有N―末端氨基酸為黃色
2、DNP―氨基酸衍生物,其余的都是游離氨基酸。②丹磺酰氯(DNS)法:多肽或蛋白質(zhì)的游離末端氨基與與丹磺酰氯(DNS―Cl)反應(yīng)生成DNS―多肽或DNS―蛋白質(zhì)。由于DNS與氨基形成的鍵對(duì)酸水解遠(yuǎn)比肽鍵穩(wěn)定,因此DNS―多肽經(jīng)酸水解后,只有N―末端氨基酸為強(qiáng)烈的熒光物質(zhì)DNS―氨基酸,其余的都是游離氨基酸。③苯異硫氰酸脂(PITC或Edman降解)法:多肽或蛋白質(zhì)的游離末端氨基與異硫氰酸苯酯(PITC)反應(yīng)(Edman反應(yīng)),生成苯氨基硫
3、甲酰多肽或蛋白質(zhì)。在酸性有機(jī)溶劑中加熱時(shí),N―末端的PTC―氨基酸發(fā)生環(huán)化,生成苯乙內(nèi)酰硫脲的衍生物并從肽鏈上掉下來,除去N―末端氨基酸后剩下的肽鏈仍然是完整的。④氨肽酶法:氨肽酶是一類肽鏈外切酶或叫外肽酶,能從多肽鏈的N端逐個(gè)地向里切。根據(jù)不同的反應(yīng)時(shí)間測出酶水解釋放的氨基酸種類和數(shù)量,按反應(yīng)時(shí)間和殘基釋放量作動(dòng)力學(xué)曲線,就能知道該蛋白質(zhì)的N端殘基序列。(2)C―末端測定法:常采用肼解法、還原法、羧肽酶法。肼解法:蛋白質(zhì)或多肽與無水肼
4、加熱發(fā)生肼解,反應(yīng)中除C端氨基酸以游離形式存在外,其他氨基酸都轉(zhuǎn)變?yōu)橄鄳?yīng)的氨基酸酰肼化物。②還原法:肽鏈C端氨基酸可用硼氫化鋰還原成相應(yīng)的α―氨基醇。肽鏈完全水解后,代表原來C―末端氨基酸的α―氨基醇,可用層析法加以鑒別。③羧肽酶法:是一類肽鏈外切酶,專一的從肽鏈的C―末端開始逐個(gè)降解,釋放出游離的氨基酸。被釋放的氨基酸數(shù)目與種類隨反應(yīng)時(shí)間的而變化。根據(jù)釋放的氨基酸量(摩爾數(shù))與反應(yīng)時(shí)間的關(guān)系,便可以知道該肽鏈的C―末端氨基酸序列。2測
5、得一種血紅蛋白含鐵0.426%,計(jì)算其最低相對(duì)分子質(zhì)量。一種純酶按質(zhì)量計(jì)算含亮氨酸1.65%和異亮氨酸2.48%,問其最低相對(duì)分子質(zhì)量是多少?解答解答:(1)血紅蛋白:55.8100100131000.426???鐵的相對(duì)原子質(zhì)量最低相對(duì)分子質(zhì)量==鐵的百分含量(2)酶:因?yàn)榱涟彼岷彤惲涟彼岬南鄬?duì)分子質(zhì)量相等,所以亮氨酸和異亮氨酸的殘基數(shù)之比(2)鑒定肽的氨基末端殘基。(3)不含二硫鍵的蛋白質(zhì)的可逆變性。若有二硫鍵存在時(shí)還需加什么試劑?
6、(4)在芳香族氨基酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。(5)在甲硫氨酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。(6)在賴氨酸和精氨酸殘基側(cè)水解肽鍵。解答解答:(1)異硫氰酸苯酯;(2)丹黃酰氯;(3)脲;?巰基乙醇還原二硫鍵;(4)胰凝乳蛋白酶;(5)CNBr;(6)胰蛋白酶。6由下列信息求八肽的序列。(1)酸水解得Ala,Arg,Leu,Met,Phe,Thr,2Val。(2)Sanger試劑處理得DNPAla。(3)胰蛋白酶處理得Ala,Arg,Thr和Leu,Me
7、t,Phe,2Val。當(dāng)以Sanger試劑處理時(shí)分別得到DNPAla和DNPVal。(4)溴化氰處理得Ala,Arg,高絲氨酸內(nèi)酯,Thr,2Val,和Leu,Phe,當(dāng)用Sanger試劑處理時(shí),分別得DNPAla和DNPLeu。解答:由(2)推出N末端為Ala;由(3)推出Val位于N端第四,Arg為第三,而Thr為第二;溴化氰裂解,得出N端第六位是Met,由于第七位是Leu,所以Phe為第八;由(4),第五為Val。所以八肽為:Al
8、aThrArgValValMetLeuPhe。7一個(gè)α螺旋片段含有180個(gè)氨基酸殘基,該片段中有多少圈螺旋?計(jì)算該α螺旋片段的軸長。解答:1803.6=50圈,500.54=27nm,該片段中含有50圈螺旋,其軸長為27nm。8當(dāng)一種四肽與FDNB反應(yīng)后,用5.7molLHCl水解得到DNPVal及其他3種氨基酸;當(dāng)這四肽用胰蛋白酶水解時(shí)發(fā)現(xiàn)兩種碎片段;其中一片用LiBH4(下標(biāo))還原后再進(jìn)行酸水解,水解液內(nèi)有氨基乙醇和一種在濃硫酸條件
9、下能與乙醛酸反應(yīng)產(chǎn)生紫(紅)色產(chǎn)物的氨基酸。試問這四肽的一級(jí)結(jié)構(gòu)是由哪幾種氨基酸組成的?解答解答:(1)四肽與FDNB反應(yīng)后,用5.7molLHCl水解得到DNPVal,證明N端為Val。(2)LiBH4還原后再水解,水解液中有氨基乙醇,證明肽的C端為Gly。(3)水解液中有在濃H2SO4條件下能與乙醛酸反應(yīng)產(chǎn)生紫紅色產(chǎn)物的氨基酸,說明此氨基酸為Trp。說明C端為Gly-Trp…(4)根據(jù)胰蛋白酶的專一性,得知N端片段為Val-Arg(
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