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1、DNARNA的提取、純化與鑒定的提取、純化與鑒定編輯詞條編輯詞條發(fā)表評(píng)論發(fā)表評(píng)論(0)目錄??DNA的提取純化??基因組DNA的提取??從植物組織提取基因組DNA??從動(dòng)物組織提取基因組DNA??細(xì)菌基因組DNA的制備??基因組DNA的檢測(cè)??組織DNA的提取和純化??石蠟包埋組織的DNA提取及其應(yīng)用??外周血DNA提取技術(shù)??真核細(xì)胞DNA的制備??植物組織中DNA的提取??細(xì)菌DNA的提取方法??真菌DNA提取總結(jié)的兩種方法??組織
2、mRNA提取操作步驟??RNA酶活性的控制??用異硫氰酸胍和有機(jī)溶劑提取RNA??mRNA的分離??哺乳動(dòng)物細(xì)胞總RNA的分離??植物總RNA的分離??植物mRNA的分離??PCR常見問題分析??瓊脂糖凝膠DNA回收常見問題分析??RNA提取常見問題分析??DNA電泳常見問題分析??質(zhì)粒提取常見問題分析??凝膠電泳操作注意事項(xiàng)??實(shí)驗(yàn):DNA片段的回收及純化??實(shí)驗(yàn):RNA的提取及其純度檢測(cè)[顯示部分]DNA的提取純化編輯本段回目錄一、
3、細(xì)菌培養(yǎng)物的生長(zhǎng)從瓊脂平板上挑取一個(gè)單菌落,接種到培養(yǎng)物中(有含有行當(dāng)抗生素的液體培養(yǎng)基中生長(zhǎng)),然后從中純化質(zhì)粒,質(zhì)粒的提純幾乎總是如此?,F(xiàn)在使用的許多質(zhì)粒載體(如pUC系列)都能復(fù)制到很高的拷貝數(shù),惟致只要將培養(yǎng)物放在標(biāo)準(zhǔn)LB培養(yǎng)基中生長(zhǎng)到對(duì)數(shù)晚期,就可以大量提純質(zhì)粒。此時(shí),不必造反性地?cái)U(kuò)增質(zhì)粒DNA。然而,較長(zhǎng)一代的載體(如pBR322)由于不能如此自由地復(fù)制,所以需要在得到部分生長(zhǎng)的細(xì)菌培養(yǎng)物中加入氯霉素繼續(xù)培養(yǎng)若干小時(shí),以便對(duì)
4、質(zhì)粒進(jìn)行性擴(kuò)增。氯霉素可抑制宿主的蛋白質(zhì)合成,結(jié)果阻止了細(xì)菌染色體的復(fù)制,然而,松弛型質(zhì)粒仍可繼續(xù)復(fù)制,在若干小時(shí)內(nèi),其拷貝數(shù)持續(xù)遞增。這樣,像pBR322-類的質(zhì)粒,從經(jīng)氯霉素處理和未經(jīng)處理的培養(yǎng)物中提取質(zhì)粒的產(chǎn)量迥然不同,前者大為增高。多年來,加入足以完全抑制蛋白質(zhì)合成的氯霉素(μgml)已繼續(xù)嵌入。但線狀分子不受此限,可繼續(xù)結(jié)合更多的染料,直至達(dá)到飽和(每2個(gè)堿基對(duì)大約結(jié)合1個(gè)溴化乙錠分子)(Cant和Schimmel1980)。
5、由于染料的結(jié)合量有所差別,線狀和閉環(huán)DNA分了在含有飽和量溴化乙錠的氯化銫度中的浮力密度也有所不同。多年來,氯化銫-溴化乙錠梯度平衡離心已成為制備大量質(zhì)粒DNA的首選方法。然而該過程既昂貴又費(fèi)時(shí),為此發(fā)展了許多替代方法。其中主要包括利用離子交換層析、凝膠過濾層析、分級(jí)沉淀等分離質(zhì)粒DNA和宿主DNA的方法。盡管這些方法大多數(shù)均被束之高閣,但其中最好的方法,也應(yīng)是聚乙二醇分級(jí)沉淀法,最近已得到改進(jìn)(R.Treisman個(gè)人通訊)并達(dá)到較高
6、境界,使用該方法可得到極高純度的質(zhì)粒。聚乙二醇分級(jí)沉淀法與氯化銫-溴化乙錠梯度平衡離心法有一點(diǎn)不同,那就是不能有效地把帶切口的環(huán)狀分子同閉環(huán)質(zhì)粒DNA分開,因此,純化容易帶上切口的極大質(zhì)粒(大于15kb)及用于生物物理學(xué)測(cè)定的閉環(huán)質(zhì)粒時(shí)、平衡離心仍是首選的方法。然而,兩種純化方法都可得到足可勝任分子克隆中各種復(fù)雜工作的質(zhì)粒DNA,包括用于哺乳動(dòng)物細(xì)胞的轉(zhuǎn)染以及利用外切核酸酶產(chǎn)生成套的缺失突變體??尚?,對(duì)于更常規(guī)的操作,則可全然免卻進(jìn)一步
7、提純的問題。目前所用的質(zhì)粒大多數(shù)復(fù)制量大,小量制備質(zhì)粒即可得到足量的DNA完成以下種種工作;限制酶圖的繪制、細(xì)菌轉(zhuǎn)化、特定DNA片段的分離、常規(guī)亞克隆及放射性標(biāo)記探針的制備。四、質(zhì)粒DNA的小量制備一)細(xì)菌的收獲和裂解1、收獲1)將2ml含相應(yīng)抗生素的LB加入到容量為15ml并通氣良好(不蓋緊)的試管中,然后接入一單菌落,于30℃劇烈振搖下培養(yǎng)過夜。2)將1.5ml培養(yǎng)物倒入微量離心管中,用微量離心機(jī)于4℃以12000g離心30秒,將剩
8、余的培養(yǎng)物貯存于4℃。3)吸去培養(yǎng)液,使細(xì)菌沉淀盡可能干燥。除去上清的簡(jiǎn)便方法是用一次性使用的吸頭與真空管道相連,輕緩抽吸,并用吸頭接觸液面。當(dāng)液體從管中吸出時(shí),盡可能使吸頭遠(yuǎn)離細(xì)菌沉淀,然后繼續(xù)用吸頭通過抽真空除去附于管壁的液滴。2、煮沸裂解該法根據(jù)Holmex和Quigley(1985)的方法改進(jìn)而成。1)將細(xì)菌沉淀[收獲細(xì)菌和步驟3)所得]重懸于350μlSTET中。STET0.1molLNaC10mmolLTris.Cl(pH8
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