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文檔簡介
1、STATA軟件的應(yīng)用,--- 流行病學(xué)資料的分析,非常簡便、快速,流行病學(xué)資料的分析,病例對照研究資料 成組病例對照研究 配對病例對照研究 隊列研究資料,例1(成組病例對照研究) 某單位研究胸膜間皮瘤與接觸石棉的關(guān)系,資料見下表。試對其進行分析。,成組病例對照研究分析,?2檢驗:接觸石棉與胸膜間皮瘤的關(guān)系計算OR:反映接觸石棉與胸膜間皮瘤的關(guān)系大小計算OR95%的置信區(qū)間:與?2檢驗等價,成組病例對照分析
2、,cc 病例變量 暴露變量 [fw=頻數(shù)變量]cci #a #b #c #d,成組病例對照分析,cc case exposure [fw=f]cci 40 36 9 67,解釋:優(yōu)勢比OR = 8.27, 其95% CI(3.42,21.33) ?2 = 28.94 , P = 0.0000 由此可見,接觸石棉者發(fā)生間皮瘤的危險性為未接觸者的8.27倍。
3、,Proportion | Exposed Unexposed | Total Exposed-----------------+------------------------+---------------------- Cases | 40 36 | 76 0.5263 Co
4、ntrols | 9 67 | 76 0.1184-----------------+------------------------+---------------------- Total | 49 103 | 152 0.3224 |
5、 | | Point estimate | [95% Conf. Interval] |------------------------+---------------------- Odds ratio | 8.271605 | 3.4193 21.33091 (exact)
6、Attr. frac. ex. | .8791045 | .7075425 .9531197 (exact) Attr. frac. pop | .4626866 | +----------------------------------------------- chi2(1)
7、 = 28.94 Pr>chi2 = 0.0000,病例對照研究資料---聯(lián)系強度指標(biāo),OR= ad/bc,例2(多暴露水平成組病例對照研究資料)某醫(yī)院一項吸煙與膀胱癌關(guān)系的病例對照研究得到如下結(jié)果,試分析吸煙量與膀胱癌是否存在劑量-反應(yīng)關(guān)系?,多暴露水平成組病例對照研究,目的:多個暴露水平的劑量-反應(yīng)相關(guān)分析 方法:趨勢?2檢驗 H0:吸煙量與膀胱癌不存在劑量-反應(yīng)線性關(guān)系 H1: 吸煙量
8、與膀胱癌存在劑量-反應(yīng)線性關(guān)系,,多暴露水平成組病例對照分析,tabodds 病例變量 暴露變量 [fw=頻數(shù)變量],or base(#) or:指定輸出各組的or值 base (#):指定以哪組作為參照估計各組的or值,默認(rèn)是第一組作為參照。,數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),解釋:OR的同質(zhì)性檢驗:?2 =17.52,P=0.0006,即各組OR不全同。 OR的趨勢檢驗:?2 =15.14,P=0.0001,故可用認(rèn)為隨
9、著吸煙量的增加患膀胱癌的危險性也增加。,tabodds case smoke [fw=f], or --------------------------------------------------------------------------- smoke | Odds Ratio chi2 P>chi2 [95% Conf. Interval]-------------
10、+------------------------------------------------------------- 0 | 1.000000 . . . . 1 | 0.854167 0.11 0.7358 0.341623 2.135687
11、 2 | 1.634058 1.55 0.2130 0.748525 3.567210 3 | 3.548077 13.40 0.0003 1.719470 7.321353-------------------------------------------------------------------------
12、--Test of homogeneity (equal odds): chi2(3) = 17.52 Pr>chi2 = 0.0006Score test for trend of odds: chi2(1) = 15.14 Pr>chi2 = 0
13、.0001,例3 (分層病例對照資料) 在吸煙與肺癌發(fā)生關(guān)系的研究中,年齡是一個混雜因素,試根據(jù)下列資料計算調(diào)整年齡后吸煙與肺癌發(fā)生關(guān)系的優(yōu)勢比,并作假設(shè)檢驗。,分層病例對照研究,目的:按混雜因素分層,控制混雜因素的影響。方法:Mantel-Haenszel分層分析 (1)公共優(yōu)勢比ORM-H的估計算公式為:(2)對公共優(yōu)勢比進行假設(shè)檢驗, 統(tǒng)計量為:,,,,,分層病例對照分析,cc 病例變量 暴露變量 [fw=頻數(shù)變
14、量],by(分層變量) mhodds 病例變量 暴露變量 [fw=頻數(shù)變量] ,by(分層變量),數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),cc case smoke [fw=f],by(age),age | OR [95% Conf. Interval] M-H Weight-----------------+-------------------------------------------------
15、 0 | 2.224658 1.437382 3.430672 14.28571 (exact) 1 | 4.174907 2.554659 6.821394 7.819588 (exact)-----------------+-------------------------------------------------
16、 Crude | 2.747456 2.011688 3.743611 (exact) M-H combined | 2.914544 2.143308 3.963297 -------------------------------------------------------------------Test of homogenei
17、ty (M-H) chi2(1) = 3.94 Pr>chi2 = 0.0470 Test that combined OR = 1: Mantel-Haenszel chi2(1) = 49.43 Pr&
18、gt;chi2 = 0.0000,結(jié)果解釋,粗的OR=2.75;調(diào)整年齡后,ORMH=2.91。?2MN=49.43,v=1,P=0.0000,差別有統(tǒng)計學(xué)意義,故可認(rèn)為調(diào)整年齡后,吸煙1包/天以上者患肺癌的危險度是1包/天以下者的2.91倍。,例4(配對病例-對照研究) 某單位為研究軟組織肉瘤與接觸苯氧乙酸或氯酚的關(guān)系,作了一次病例-對照研究,結(jié)果見下表。,配對四格表資料,方法:McNemar檢驗公式:,b+c ≤ 40,b
19、+c>40,配對病例對照分析,mcc 暴露-病例數(shù) 暴露-對照數(shù) [fw=頻數(shù)變量]mcci #a #b #c #d,mcci 3 16 3 30 | Controls |Cases | Exposed Unexposed | Total-----------------+---------------
20、---------+---------- Exposed | 3 16 | 19 Unexposed | 3 30 | 33-----------------+------------------------+---------- Total | 6
21、 46 | 52McNemar's chi2(1) = 8.89 Prob > chi2 = 0.0029Exact McNemar significance probability = 0.0044Proportion with factor Cases .3653846 Controls .1153846 [
22、95% Conf. Interval] --------- -------------------- difference .25 .0811853 .4188147 ratio 3.166667 1.422659 7.048617 rel. diff. .2826087 .125
23、3028 .4399146 odds ratio 5.333333 1.526627 28.56284 (exact),b+c < 40,b+c≥40,結(jié)果解釋,OR=5.33,其95% CI為(1.53, 28.56)。 本例樣本例數(shù)較少,應(yīng)計算確切概率。P = 0.0044,差別有統(tǒng)計學(xué)意義,故可認(rèn)為接觸苯氧乙酸或氯酚者發(fā)生軟組織肉瘤的危險性為不接觸者的5.33倍。,流行病
24、學(xué)資料的分析,病例對照研究資料 成組病例對照研究 配對病例對照研究 隊列研究資料,例5(隊列研究資料) 就下表資料分析母親乳汁中IgG抗體滴度高低與6個月以上嬰兒患呼吸道疾病的關(guān)系。,隊列研究分析,?2檢驗:分析母親乳汁中IgG抗體滴度與呼吸道疾病的關(guān)系。計算RR:分析母親乳汁中IgG抗體滴度與呼吸道疾病的關(guān)系大小。計算RR95%的置信區(qū)間,隊列研究(Cohort studies)分析,cs 病例變量
25、暴露變量 [fw=頻數(shù)變量]csi #a #b #c #d,隊列研究分析,cs case exposure [fw=f]csi 16 5 7 10,| Exposed Unexposed | Total-----------------+------------------------+---------- Cases | 16
26、5 | 21 Noncases | 7 10 | 17-----------------+------------------------+---------- Total | 23 15 | 38 | |
27、 Risk | .6956522 .3333333 | .5526316 | Point estimate | [95% Conf. Interval] |------------------------+---------------------- Risk difference | .36231
28、88 | .0585558 .6660819 Risk ratio | 2.086957 | .9711058 4.484977 Attr. frac. ex. | .5208333 | -.0297539 .7770334 Attr. frac. pop | .3968254 |
29、 +----------------------------------------------- chi2(1) = 4.82 Pr>chi2 = 0.0281,解釋:率差RD= 0.3623, 95% CI: 0.059, 0.666) 相對危險度RR = 2.086, 95% CI: (0.971,
30、4.485) 歸因危險度 AR = 0.521, 其95% CI(-0.030 ,0.777) 人群歸因危險度PAR = 0.397 ?2 = 4.82,P = 0.0281 ,可認(rèn)為母親乳汁中IgG抗體滴度高低與嬰兒呼吸道疾患發(fā)生率有關(guān),滴度較低者其嬰兒較易患呼吸道疾病。,隊列研究資料---聯(lián)系強度指標(biāo),率差RD=P1-P0相對危險度RR =P1/P0
31、歸因危險度 AR=(P1- P0 )/P1人群歸因危險度PAR =(P - P0 )/P,例6(分層隊列研究)某人隨訪研究甲糖寧治療糖尿病人的效果,其中年齡被認(rèn)為是可能的混雜因素,需要對年齡進行分層分析。,分層隊列研究分析,cs 病例變量 暴露變量 [fw=頻數(shù)變量],by(分層變量),數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),cs d expose [fw=f],by(age),age | RR [95% Conf. Inter
32、val] M-H Weight-----------------+------------------------------------------------- 0 | 1.811321 .6112044 5.367898 2.345133 1 | 1.332908 .7471514 2.37789 8.124
33、352 -----------------+------------------------------------------------- Crude | 1.505602 .8917924 2.54189 M-H combined | 1.440071 .8637914 2.400817------------------------
34、-------------------------------------------Test of homogeneity (M-H) chi2(1) = 0.240 Pr>chi2 = 0.6244,粗的RR=1.51;調(diào)整年齡后,RRMH=1.44,其95%CI:0.86-2.40,差別無統(tǒng)計學(xué)意義,故調(diào)整年齡后,還不能認(rèn)為甲糖寧治療糖尿病人有效。,小結(jié),病例對照研究 成組病例對照: cc
35、 case expose [fw=f]/cci #a #b #c #d cc case expose [fw=f],by(混雜變量)分層分析 tabodds case expose [fw=f],or base(#)多暴露水平 配對病例對照:mcc r c [fw=f]/mcci #a #b #c #d隊列研究 cs case expose [fw=f] /csi #a #b
36、 #c #d cs case expose [fw=f],by(混雜變量)分層分析,課堂練習(xí)1:,課堂練習(xí)2:例18-5 在食管癌與飲酒關(guān)系的分析中,年齡可能是混雜因素。將每日飲酒量的資料按年齡組分解成4個四格表(表18-3),估計出各層的OR值,可見不同年齡組的OR有所不同。試進行Mantel-Haenszel分層分析。,課堂練習(xí)3:例18-6 仍然用食管癌與飲酒關(guān)系的研究資料,按照每日飲酒量將暴露水平分成四組,資料
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