京海黃雞IGF-I基因多態(tài)性與生產(chǎn)性能的關(guān)系及其遺傳規(guī)律的研究.pdf

1、本研究以雞IGF-I基因作為影響雞生長性能和產(chǎn)蛋性能的候選基因，采用測序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技術(shù)分析了該基因5'UTR核苷酸序列的變異，并研究IGF-Ⅰ基因?qū)┖｜S雞的生長性狀的影響；對所發(fā)現(xiàn)的基因在京海黃雞連續(xù)3個世代的遺傳特性進行了研究，探討多態(tài)性與生長性狀的關(guān)系，挖掘新的有利于經(jīng)濟性狀的基因座位，以及選育過程對IGF-Ⅰ基因在世代間傳遞的影響。利用優(yōu)良基因，最終通過標(biāo)記輔助選擇可以加速經(jīng)濟性狀的改良速度和新品種的培

2、育進程，從而為我國雞的標(biāo)記輔助選擇提供新的有效的分子標(biāo)記，積累有價值的參考資料。本論文得到的結(jié)論如下：
　　 利用測序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技術(shù)分析了該基因5'UTR核苷酸序列的變異，共發(fā)現(xiàn)8個多態(tài)位點，其中7個SNP多態(tài)位點，一個小片段GAAAA的插入。7個SNP中5個為GA突變，一個CT突變，均為轉(zhuǎn)換，一個AC突變屬于顛換。按其所在DNA序列位置將突變位點命名分別為：G49754A、G49778A、G49824

3、A、A49944C、G49961A、G50034A、DelGAAAA50077以及C50180T。
　　 G49754A、G49778A和G50034A位置突變分別導(dǎo)致Tru1I和TaiI和PstI酶切位點發(fā)生改變，并發(fā)現(xiàn)PstI酶切位點與Nagaraja等發(fā)現(xiàn)的PstI酶切位點為同一酶切位點。
　　 Tru1I和TaiI酶切結(jié)果及SSCP結(jié)果均顯示G49754A和G49778A位點完全連鎖，實驗中將G49754A和G4

4、9778A位點看做一個位點記為G49754A/G49778A位點。
　　 PstI酶切時發(fā)現(xiàn)DelGAAAA50077位點的N等位基因總是與G50034A位點A等位基因同時出現(xiàn)，說明在京海黃雞中G50034A位點的A等位基因和DelGAAAA50077位點的N等位基因可能為連鎖。
　　 本文研究了京海黃雞、尤溪麻雞以及AA雞中G49754A/G49778A、G50034A和DelGAAAA50077位點的基因型，表明外來

5、雞種AA雞未檢測到突變；G49754A/G49778A和G50034A位點在京海黃雞和尤溪麻雞中均以雜合型居多；DelGAAAA50077位點只有京海黃雞中檢測到。
　　 連鎖不平衡分析結(jié)果顯示京海黃雞中G49754A與G49778A為完美連鎖不平衡，G50034A與DelGAAAA50077位點間具有很強連鎖不平衡，G49754A/G49778A與G50034A位點間達到了較強的連鎖不平衡關(guān)系；G49754A/G49778A和

6、DelGAAAA50077位點之間連鎖不平衡則較弱。
　　 京海黃雞中G49754A/G49778A、G50034A和DelGAAAA50077位點理論上應(yīng)有8種單倍型組合，實際檢測出有效單倍型(P＞0.03)只有4種，其中又以AAGN、GGAN單倍型組合為主。
　　 通過IGF-Ⅰ基因G49754A/G49778A、G50034A和DelGAAAA50077位點各基因型與產(chǎn)蛋性狀的相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)，3個多態(tài)位點與300日

7、齡產(chǎn)蛋數(shù)和平均蛋重均無顯著影響(P＞0.05)。
　　 與生長性狀的相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)，G49754A/G49778A位點對初生重有顯著差異外，對4、8周齡體重均無影響，12、16周齡以及300日齡體重中AA/AA基因型均大于其他基因型，可以推斷在12周齡之后增重中A/A等位基因為優(yōu)勢基因。G50034A位點對初生重、4、8周齡體重均無影響，12、16周齡以及300日齡體重中GG型均大于其他基因型，可以推斷在12周齡之后增重中G等位

8、基因為優(yōu)勢基因。DelGAAAA50077位點對初生重、4、8、12、16周齡以及300日齡體重中DD型均小于NN型和ND型，且NN型16周齡體重顯著大于DD型。
　　 本文研究了G49754A/G49778A、G50034A、DelGAAAA50077、InsAA56493和G95852A位點(后2個位點為實驗室之前發(fā)現(xiàn)的突變位點)連續(xù)3個世代的遺傳規(guī)律，結(jié)果表明G49754A/G49778A、G50034A和G95852A位

9、點基因型頻率呈規(guī)律性變化。G49754A/G49778A位點AA/AA型頻率由7世代0.234到9世代0.393，AA等位基因由7世代0.493增加到9世代0.628；G50034A位點的AA基因型頻率由7世代0.291增加到9世代0.325，A等位基因在7世代的0.541增加到9世代0.573；G95852A位點GG型頻率由7世代的0.110到9世代的0.308，G等位基因頻率隨著世代的增加由7世代0.344增加到9世代0.547。<