傳染性支氣管炎病毒的基因分型及S1基因和N基因遺傳多樣性分析.pdf

1、雞傳染性支氣管炎（Infectious Bronchitis，IB）是由雞傳染性支氣管炎病毒（Infectious Bronchitis virus，IBV）引起的一種急性、高度接觸性呼吸道病，主要侵害雞的呼吸系統(tǒng)、泌尿生殖系統(tǒng)和消化系統(tǒng)。以臨床癥狀復雜、病理變化多、血清型多和容易發(fā)生變異等為特征，是一種生產意義巨大、影響廣泛的傳染性疫病。
　　 IBV目前有20多個血清型，不同血清型之間缺乏交叉保護，但中和試驗十分繁瑣，從而給

2、本病的診斷和防治帶來困難。分子克隆測序是進行IBV分子病原研究的重要手段，通過生物信息學比較，可以快速了解IBV不同病毒之間、不同基因的演化趨勢。
　　 本論文結合1992-2008年間從山東乃至全國分離鑒定的IBV毒株，在進行抗原性和致病性研究的基礎上，對17株IBV毒株分別進行了S1基因和N基因的克隆測序。選取GenBank中具有代表意義的50多株參考株（含疫苗株），結合我們所測定的序列，分別進行核苷酸和氨基酸同源比較，進而

3、分析探討IBV S1和N基因之間遺傳變異的相關性及其全長與片段遺傳變異的相關性。結果表明：S1基因和N基因之間的遺傳變異均具有多樣性。與常規(guī)疫苗株和國外參考株相比，無論是核苷酸還是氨基酸均發(fā)生了較大的變異。以S1基因為例，17株IBV流行株僅有一株與疫苗株（H120）同源，比例較低（占5.88％）；與H120的nt/aa同源性均低于80％。不同IBV毒株S1基因片段與其全長之間遺傳變異高度相關（r=0.963）；N基因呈現(xiàn)出與S1基因同

4、樣的規(guī)律性（r=0.976）!不同IBV毒株S1基因和N基因全長之間遺傳變異高度相關（r=0.645），顯示出S1基因和N基因之間的遺傳變異既具有同步性，又具有一定的獨立性!此外，IBV流行株與疫苗株的遺傳距離，無論在S1基因還是N基因，愈來愈遠，彰顯出IBV流行株在H120的免疫壓力下，已經發(fā)生了較大程度的變異。
　　 根據(jù)IBV流行株S1基因和N基因的核苷酸同源性，按病毒發(fā)生的年代和地域以及致病性，初步將S1基因和N基因分為