28897.不同外源擾動(dòng)因素對(duì)腸道菌群組成結(jié)構(gòu)影響的研究

1、上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文不同外源擾動(dòng)因素對(duì)腸道菌群組成結(jié)構(gòu)影響的研究姓名：魏華申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：微生物學(xué)指導(dǎo)教師：趙立平20081001摘要第3，5，9周大鼠的新鮮糞便樣本，應(yīng)用優(yōu)勢(shì)細(xì)菌(16SrRNA基因的V3區(qū))PCRDGGE以及擬桿菌、柔嫩梭菌、乳酸菌和雙歧桿菌的類群特異性PCRDGGE方法結(jié)合多變量統(tǒng)計(jì)分析包括主成分分析(Principalcomponentanalysis，PCA)與最小偏二乘判別分析(Partialle

2、astsquaresdiscriminantanalysis，PLSDA)，對(duì)大鼠的腸道菌群組成進(jìn)行動(dòng)態(tài)分析。分析結(jié)果顯示，單純二甲肼誘導(dǎo)組大鼠的腸道優(yōu)勢(shì)細(xì)菌與柔嫩梭菌的組成在實(shí)驗(yàn)第3周與健康對(duì)照組沒(méi)有明顯差異，在實(shí)驗(yàn)第5周與健康對(duì)照組具有差異趨勢(shì)，而在實(shí)驗(yàn)第9周，當(dāng)單純二甲肼誘導(dǎo)大鼠形成(37726)個(gè)異常隱窩病灶(Aberrantcryptfoci，ACF)／全結(jié)腸時(shí)，其腸道優(yōu)勢(shì)細(xì)菌與柔嫩梭菌的組成與未見明顯ACF的健康對(duì)照組具有明

3、顯差異，Martens’uncertaintytest結(jié)合ANOVA檢驗(yàn)◇O05)結(jié)果提示優(yōu)勢(shì)細(xì)菌中的2條PCRDGGE條帶與柔嫩梭菌的5條PCRDGGE條帶是區(qū)分第9周2組動(dòng)物腸道菌群的重要PCRDGGE條帶，將這些條帶進(jìn)行割膠測(cè)序，這些條帶為Ruminococcusobeum與Allobaculumstercoricanis等的類似菌。針對(duì)部分差異序列設(shè)計(jì)特異引物，熒光定量PCR的結(jié)果證實(shí)，實(shí)驗(yàn)9周，單純二甲肼誘導(dǎo)組大鼠的腸道Rum

4、inococcusobeum與Allobaculumstercoricanis的類似菌數(shù)量明顯高于健康對(duì)照組，差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，與PCRDGGE結(jié)果相符。單純二甲肼誘導(dǎo)組大鼠腸道中乳酸菌和雙歧桿菌的組成沒(méi)有發(fā)生明顯改變，其雙歧桿菌數(shù)量也沒(méi)有明顯改變。本研究結(jié)果提示，與健康對(duì)照組相比，動(dòng)態(tài)監(jiān)控疾病高危動(dòng)物或人群的腸道菌群組成可能會(huì)成為一種無(wú)損傷性的評(píng)估宿主健康狀態(tài)的方法，腸道菌群組成偏離健康群體的動(dòng)物，其機(jī)體的健康狀態(tài)可能也發(fā)生了改變。