不同鼠種的腸道菌群在不同飲食結(jié)構(gòu)干預(yù)中的組成改變.pdf

1、目的:采取454高通量測(cè)序方法對(duì)不同飲食結(jié)構(gòu)喂養(yǎng)的不同鼠種腸道菌群進(jìn)行分析，觀察并闡明不同的飲食結(jié)構(gòu)下腸道多樣性及群落結(jié)構(gòu)的組成差異，同時(shí)進(jìn)一步比較飲食對(duì)腸道菌群的影響在不同鼠種之間是否存在種屬差異，為研究不同人種在同種飲食結(jié)構(gòu)下在肥胖、炎癥性腸病等的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)上仍存在差異的原因提供線(xiàn)索。
　　方法:選取仍處于腸道菌群建立階段的剛斷乳Bal b/c小鼠及SD大鼠作為研究載體，采取為期2個(gè)月的五種特制的不同結(jié)構(gòu)飲食干預(yù)方法，收集各個(gè)飲

2、食組新鮮糞便樣品，提取糞便細(xì)菌總基因組DNA，對(duì)細(xì)菌16SrRNA基因序列V1-V3高變區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物并切膠回收純化。定量檢測(cè)PCR產(chǎn)物，按照每個(gè)樣品的測(cè)序量要求，進(jìn)行相應(yīng)比例的混合。寄往中國(guó)上海美吉生物醫(yī)藥科技公司進(jìn)行454 GS FLX測(cè)序。
　　結(jié)果:多樣性分析結(jié)果顯示，同一鼠種不同飲食組腸道菌群多樣性存在差異，同時(shí)，同種飲食干預(yù)對(duì)腸道菌群多樣性的影響在兩種鼠種中也存在差異。Bal b/c小鼠高脂組腸道

3、菌群多樣性最高，顯著高于高纖維組、高蛋白組(P＜0.05)。SD大鼠高蛋白組腸道菌群多樣性最高，但無(wú)論是Bal b/c小鼠還是SD大鼠，各飲食組中高纖維飲食的OTU數(shù)目及總菌多樣性均為最低。分類(lèi)學(xué)分析結(jié)果表明所有飲食組的大小鼠腸道菌群均以厚壁菌門(mén)及擬桿菌門(mén)為主要優(yōu)勢(shì)菌。Bal b/c小鼠中，厚壁菌門(mén)在普通飲食組相對(duì)豐度最高，普通飲食組的厚壁菌門(mén)的構(gòu)成比例顯著高于其他各飲食組(P＜0.05)。其次為高糖飲食組及高脂飲食組，此兩組的厚壁菌門(mén)

4、比例均顯著高于高纖維組、高蛋白組(P＜0.05)。高纖維飲食組中厚壁菌門(mén)相對(duì)豐度最低，高蛋白組次之，此兩組之間厚壁菌門(mén)比例差異不明顯(P＞0.05)。高纖維飲食組擬桿菌門(mén)的相對(duì)豐度最高，高蛋白組次之，此兩組擬桿菌門(mén)比例顯著高于其他各飲食組(P＜0.05)，其次為高糖組、高脂組，普通飲食組中擬桿菌門(mén)相對(duì)豐度最低，顯著低于其他各飲食組(P＜0.05)。變形菌門(mén)雖然在各個(gè)飲食組的所占比例均很低，但高纖維飲食組的變形菌門(mén)比例顯著低于普通飲食組及

5、高脂飲食組(P＜0.05)。SD大鼠中，高脂飲食組厚壁菌門(mén)相對(duì)豐度最高，顯著高于高蛋白組及高纖維組(P＜0.05)。其次為高糖飲食組、普通飲食組。高纖維組的厚壁菌門(mén)比例相對(duì)最低，顯著低于高脂組及高糖組(P＜0.05)。其它各組之間的厚壁菌門(mén)比例無(wú)明顯差異。擬桿菌門(mén)在高纖維飲食組相對(duì)豐度最高，顯著高于普通組、高糖組及高脂組(P＜0.05)。其次為高蛋白組，擬桿菌門(mén)的比例顯著高于高脂組(P＜0.05)。高脂飲食組相對(duì)豐度最低，顯著低于高纖維