遼寧雜草稻的遺傳多樣性及群體分化研究.pdf

1、雜草稻又名雜草型稻或雜草種系,在美國(guó)又被稱作紅米(red rice),它廣泛分布于溫帶、熱帶地區(qū),甚至一些沒(méi)有野生稻存在的地區(qū),如美國(guó)、歐洲等地.雜草稻具有雜草的一些特性,存在于栽培稻田中影響水稻的產(chǎn)量和質(zhì)量.中國(guó)作為世界上主要的稻作生產(chǎn)區(qū)之一,近年來(lái)由于直播與輕型栽培等技術(shù)的推廣,雜草稻的危害已日趨嚴(yán)重.遼寧作為中國(guó)的主要水稻產(chǎn)區(qū)之一也同樣存在著這樣的問(wèn)題.該文通過(guò)對(duì)遼寧雜草稻的RAPD及SSR分析研究了遼寧雜草稻的遺傳多樣性及群體分

2、化情況,獲得了以下一些主要結(jié)論:1.所分析的20個(gè)隨機(jī)引物共擴(kuò)增出了1 09條帶,但是只有引物S303、S4出現(xiàn)4個(gè)多態(tài)位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)所占的比例(P)只有3.7％.遼寧雜草稻總體的等位基因觀察值(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、基因多樣性指數(shù)(h)、Shannon多樣性指數(shù)(I)分別為1.0370、1.0201、0.0111、0.0168.采用的21對(duì)SSR引物中只有10對(duì)引物能在40個(gè)遼寧雜草稻樣品中的擴(kuò)增出多態(tài)的產(chǎn)物,多態(tài)位點(diǎn)所占

3、的比例約為47.62％,其Shannon多樣性指數(shù)(I)為0.2902、期望雜合度(He)為0.0393.與以往利用SSR及RAPD在研究水稻遺傳多樣性的結(jié)果相比,遼寧雜草稻基因多樣性很低.2.根據(jù)RAPD與SSR獲得的遼寧雜草稻的群體分化系數(shù)(Gst值)分別為0.8849和0.6660,表明遼寧雜草稻約有2/3的變異來(lái)自于群體間.RAPD結(jié)果的AMOVA分析顯示群體間變異占總變異的92.31％,特別是地區(qū)間的變異尤為明顯(占總變異的9

4、5.49％),地區(qū)間的分化達(dá)到了極顯著水平(P<0.001).分析的21個(gè)SSR位點(diǎn)中共有1 0個(gè)是多態(tài)位點(diǎn),其中4個(gè)位點(diǎn)上(占40％)沈陽(yáng)與丹東兩地的雜草稻有各自特異性的等位基因.這些均說(shuō)明遼寧雜草稻各群體之間的分化程度較大,特別是丹東與沈陽(yáng)兩地之間的分化更為明顯.SSR及RAPD兩種分子標(biāo)記比較分析的結(jié)果表明,雖然這兩種分子標(biāo)記在分析遼寧雜草稻遺傳多樣性及群體分化時(shí)得到了基本一致的結(jié)論,即多樣性較低但群體間分化特別是地區(qū)間分化較大.