12850.核小體結(jié)合模體的預(yù)測及它們在人類基因功能位點附近的分布

1、分類號——UDC論文題目1012620946071密級編號——核小體結(jié)合模體的預(yù)測及它們在人類基因功能位點附近的分布研究生：指導(dǎo)教師：專業(yè)：研究方向：越擻業(yè)一盟立監(jiān)絲包一奎理一理一核小體結(jié)合模體的預(yù)測及它們在人類基因功能位點附近的分布摘要基因調(diào)控的復(fù)雜模式和人類基因組的普遍轉(zhuǎn)錄以及豐富的非編碼基因，“DNA元件百科全書”計劃的這些發(fā)現(xiàn)使得人們對基因概念的認識更加廣泛，對轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)和調(diào)控機制產(chǎn)生了新的理解，并開創(chuàng)了人類認識基因組全部序列

2、功能的新開端。最近，人們對挖掘非編碼序列中可能存在的功能片段以及非編碼序列的演化和進化方面做了大量的工作。75—90％的真核生物基因組都被組裝成作為染色質(zhì)基本重復(fù)單元的核小體。DNA序列上核小體的準確定位在基因轉(zhuǎn)錄，mRNA剪接，DNA復(fù)制和DNA修復(fù)中扮演著重要的角色。盡管有許多因素可以影響核小體的定位，但現(xiàn)有的核小體定位數(shù)據(jù)顯示，核小體對特殊的DNA序列有高度的親和力，DNA本身的序列在體內(nèi)核小體定位中扮演很重要的角色。非編碼序列在

3、人類基因組中占絕大的比例，所以研究它們的特征和偏好模體對理解非編碼序列的功能和核小體定位是非常重要的。很多理論和實驗的分析指出，核小體在基因組上的分布是非均勻的，核小體分布在特定的功能位點附近表現(xiàn)特殊的形式。還有實驗數(shù)據(jù)揭示在一個核小體中，組蛋白和DNA相互作用有三個作用很強烈的區(qū)域。所有這些信息暗示，DNA序列中存在一個與組蛋白相互作用的模體集合，我們稱之為“核小體定位模體“。我們相信這些模體是核小體定位、分布和重塑的主要決定因素。轉(zhuǎn)

4、錄調(diào)控是諸多因素相互作用的復(fù)雜過程，如特殊的轉(zhuǎn)錄因子，非編碼調(diào)控元件和調(diào)節(jié)蛋白因子結(jié)合的核小體缺失區(qū)域等。核小體定位和動態(tài)的染色質(zhì)重塑調(diào)節(jié)蛋白因子與DNA序列的可接近性，表明核小體定位是轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的普遍決定因素。核小體在基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控和其他細胞過程中的重要作用，使得探索核心組蛋白與基因組DNA序列之間的相互作用成為目前分子生物學的熱點課題?；谡{(diào)研，其他研究者以前的一系列工作僅限于研究基因臨近區(qū)域的核小體組裝模式，這些與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)