76種嶺南中草藥的DNA條形碼研究.pdf

1、目的:
　　通過對目前國際熱點的植物DNA條形碼候選序列(ITS2、psbA-trnH、rbcL和matK)進行比較和評價，試圖篩選出適合唇形科、百合科、蕓香科、薔薇科和菊科藥用植物鑒定的DNA條形碼序列。
　　方法:
　　以廣州中醫(yī)藥大學(xué)藥王山嶺南常用中草藥為材料，利用試劑盒法提取唇形科、百合科、蕓香科、薔薇科和菊科共76種藥用植物的基因組DNA，使用ITS2、psbA-trnH、rbcL和matK序列的通用引物進行

2、PCR和雙向測序，通過比較各序列的擴增和測序成功率、種內(nèi)和種間的差異以及系統(tǒng)發(fā)育樹等指標來評價不同候選序列的鑒定能力。
　　結(jié)果:
　　對唇形科20個種60個樣本的分析發(fā)現(xiàn)，ITS2、psbA-trnH、rbcL、matK四個候選序列的擴增和測序成功率均為100％。ITS2序列的變異位點數(shù)最多(69.3％)，在系統(tǒng)發(fā)育樹方面，ITS2的鑒定成功率為70％、psbA-tmH的鑒定成功率為55％、rbcL的鑒定成功率為45％、m

3、atK的鑒定成功率為75％。
　　對百合科16個種45個樣本的分析發(fā)現(xiàn)，ITS2、psbA-trnH、rbcL、matK四個候選序列的擴增和測序成功率均為100％。ITS2序列的變異位點數(shù)最多(89.1％)，在系統(tǒng)發(fā)育樹方面，ITS2的鑒定成功率為87.5％、psbA-trnH的鑒定成功率為62.5％、rbcL的鑒定成功率為68.8％、matK的鑒定成功率為68.8％。
　　對蕓香科16個種32個樣本的分析發(fā)現(xiàn)，ITS2、p

4、sbA-trnH、rbcL、matK四個候選序列的擴增和測序成功率均為100％。psbA-trnH序列的變異位點數(shù)最多(64.7％)，在系統(tǒng)發(fā)育樹方面，ITS2的鑒定成功率為81.3％、psbA-trnH的鑒定成功率為81.3％、rbcL的鑒定成功率為68.8％、matK的鑒定成功率為75％。
　　對薔薇科11個種28個樣本的分析發(fā)現(xiàn)，ITS2、psbA-trnH、rbcL、matK四個候選序列的擴增和測序成功率均為100％。ma

5、tK序列的變異位點數(shù)最多(59.5％)，在系統(tǒng)發(fā)育樹方面，ITS2的鑒定成功率為100％、psbA-trnH的鑒定成功率為81.8％、rbcL的鑒定成功率為63.6％、matK的鑒定成功率為81.8％。
　　對菊科13個種39個樣本的分析發(fā)現(xiàn)，ITS2、psbA-trnH、rbcL、matK四個候選序列的擴增和測序成功率均為100％。ITS2序列的變異位點數(shù)最多(71.7％)，在系統(tǒng)發(fā)育樹方面，ITS2的鑒定成功率為100％、ps