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文檔簡介
1、研究CHO細(xì)胞密碼子使用特點(diǎn),將為從偏愛密碼子角度來探索不同外源基因在CHO細(xì)胞表達(dá)水平提供新思路.建立適用于高豐度mRNA的CHO細(xì)胞cDNA文庫,經(jīng)篩選最后剩下50個(gè)合格的編碼蛋白質(zhì)cDNA序列.統(tǒng)計(jì)CHO細(xì)胞密碼子使用頻率,與CUTG數(shù)據(jù)庫中已有中華倉鼠(CRU)密碼子使用頻率做比較,發(fā)現(xiàn)CHO中Pro,Arg使用頻率最高的密碼子分別是CCT,AGA;而CRU則為CCC,CGG;其余氨基酸的最高使用頻率的密碼子在CHO和CRU中都
2、相同.提示機(jī)體在基因表達(dá)調(diào)控下,相應(yīng)出現(xiàn)個(gè)別密碼子使用頻率的差異,這種差異雖不大,但卻可能是組織物特異表達(dá)的一種微調(diào)機(jī)制.根據(jù)相對同義密碼子使用值將該實(shí)驗(yàn)所得到的50個(gè)cDNA序列進(jìn)行對應(yīng)統(tǒng)計(jì)分析,產(chǎn)生了能解釋14.7﹪的變量第一軸,基因按照在第一軸的位置進(jìn)行排列,體現(xiàn)了基因偏向性強(qiáng)弱,說明CHO細(xì)胞基因間存在異質(zhì)性.以cDNA的Nc對GC3s作圖,初步判斷CHO的密碼子偏向性與突變偏向有關(guān).研究基因CDS和GC3s與旁側(cè)序列G+C含量
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