同義密碼子重復(fù)序列中密碼子的使用與比較.pdf_第1頁
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1、本論文共分三部分: 第一部分通過對(duì)大腸桿菌編碼序列中同義密碼子重復(fù)序列的研究,分析了同義密碼子重復(fù)序列與全部編碼序列中密碼子使用的差異:發(fā)現(xiàn)部分密碼子在同義密碼子重復(fù)序列中的使用與在全序列中的使用存在很大的差異;同義密碼子4重復(fù)片段中相同密碼子重復(fù)有明顯的位置偏好,在同義密碼子重復(fù)序列中,部分密碼子的使用與基因表達(dá)水平有關(guān)。 第二部分以6種模式生物閃爍古生球菌、枯草桿菌、大腸桿菌、釀酒酵母、線蟲和擬南芥基因組中編碼序列所

2、翻譯的氨基酸序列為樣本,研究氨基酸重復(fù)序列中氨基酸的使用情況。給出了不同長(zhǎng)度氨基酸重復(fù)片段數(shù)目的分布規(guī)律以及與生物進(jìn)化的關(guān)系,得到了氨基酸重復(fù)序列中氨基酸含量隨聯(lián)體長(zhǎng)度的變化趨勢(shì),以及氨基酸聯(lián)體最大長(zhǎng)度的分布與氨基酸疏親水、體積和極性的關(guān)系。 第三部分通過上述6種生物基因組中編碼序列的分析,得到關(guān)于密碼子在同義密碼子重復(fù)序列中的一些基本性質(zhì)。結(jié)果表明一部分密碼子在同義密碼子重復(fù)序列中的使用與其在全編碼序列中明顯不同。給出了密碼子

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