水稻抗白葉枯病種質(zhì)資源的發(fā)掘和抗病相關(guān)位點的鑒定.pdf

1、由Xanthomonas oryzae pv.Oryzae(Xoo)引起的白葉枯病是水稻生產(chǎn)中普遍發(fā)生、危害嚴(yán)重的一種細(xì)菌病害。本研究采用我國和菲律賓的4個Xoo代表菌株，人工接種評價了來源于32個國家和中國25個省份的701份基因組重測序水稻種質(zhì)資源的白葉枯病抗性，結(jié)合調(diào)查病斑長度的表型數(shù)據(jù)和實驗材料的SNPs數(shù)據(jù)進(jìn)行水稻白葉枯病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-WideAssociated Study，GWAS)，此外，通過構(gòu)建

2、遺傳分離群體，初步驗證了一些抗病相關(guān)位點。主要研究結(jié)果如下:
　　1.抗病材料的篩選:分別采用Xoo代表菌株Zhe173(C3)、GD1358(C5)、PXO61(P1)和PXO339(P9a)對701份水稻種質(zhì)資源進(jìn)行人工接種，發(fā)現(xiàn)有29份水稻種質(zhì)資源對4個Xoo菌株具有較高抗性水平，篩選到對廣東強(qiáng)毒力菌株C5表現(xiàn)抗性的品種小紅谷和豪格勞。
　　2.將白葉枯病斑長度的表型數(shù)據(jù)與水稻種質(zhì)資源的SNPs數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析

3、，檢測到包含219個基因座的5432個顯著關(guān)聯(lián)位點。其中，已精細(xì)定位的4個抗性基因(Xa32，Xa35，Xa36和Xa40)和一個已克隆Xa4位于R34和R35內(nèi);R36和R40位置接近或直接位于兩個已克隆的抗性基因(xa25和Xa26)上，此外，在1，6，7，8和10號染色體上檢測到一些新的顯著關(guān)聯(lián)位點(Chr1_32274685，P=2.4×10-12; Chr6_5823342，P=1.4×10-13; Chr7_6376139，

4、P=4.0×10-11;Chr8_3317405, P=1.8×10-14; Chr10_1520158, P=1.7×10-14)。
　　3.抗性遺傳分析和定位群體構(gòu)建:利用抗白葉枯病水稻品種山酒谷、特青選恢為供體親本，與感病品種金剛30雜交，構(gòu)建F2分離群體。通過遺傳分析鑒定的位點與全基因組關(guān)聯(lián)分析定位的位點大部分重合或接近。
　　4.基于GWAS結(jié)果，針對C5和Ⅳ菌株顯著關(guān)聯(lián)SNPs中的非同義突變SNPs位點開發(fā)了2個