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文檔簡介
1、背景:MicroRNAs(miRNA)是一類參與細胞發(fā)育、細胞分化、細胞凋亡、細胞增殖以及腫瘤發(fā)生的調(diào)節(jié)分子家族。miRNA與其靶mRNA在RISC中產(chǎn)生相互作用。miRNA與mRNA3'端非翻譯區(qū)(3'UTR)的堿基配對方式是序列特異性的,因此與成熟miRNA有互補序列的寡核苷酸鏈也具有miRNA轉(zhuǎn)錄剪切和表達沉默的功能。miRNA可以通過序列匹配作用于眾多的靶mRNA分子,干擾他們的穩(wěn)定性及相關(guān)的蛋白翻譯。因此,一個重要miRNA功
2、能缺失,將導致大量靶mRNA改變,進而影響細胞功能乃至機體整體的調(diào)節(jié)平衡。已有文獻報道m(xù)RNA的3'UTR可以通過堿基配對的方式來調(diào)節(jié)細胞質(zhì)中的miRNA的活動,因此,具有與靶mRNAYUTR相似序列的寡核苷酸鏈也可作為誘餌寡核苷酸,競爭性的與相應(yīng)的成熟miRNA結(jié)合。由此可以預測,誘餌RNA分子能夠作為外源競爭RNA(cRNA)靶向作用于成熟miRNA,并選擇性的保護相應(yīng)的mRNAs。
目的:我們通過系統(tǒng)的研究來評估合成的誘
3、餌寡核苷酸對hsa-mir-223活動的選擇性靶向作用,并將包含與成熟miR-223及靶mRNA3'UTR序列堿基配對位點的誘餌寡核苷酸用于檢測對miR-223活性的反向作用。
方法:根據(jù)成熟miR-22序列及其靶mRNA序列,利用在線演算法分析,設(shè)計并合成寡核苷酸誘餌。利用雙熒光素酶試驗通過分別包含IGF1R,F(xiàn)OXO1,POLR3G,F(xiàn)OXO3,CDC27,F(xiàn)BXW7及PAXIP1等靶mRNA3'端非編碼區(qū)(即3'UTR)
4、的熒光素酶報告質(zhì)粒中熒光素酶活性的變化來評估合成寡核苷酸誘餌對hsa-mir-223活性的影響。分別利用實時定量PCR與蛋白印跡用來測量誘餌寡核苷酸對miR-223靶向mRNA的表達水平的影響。利用CCK-8,MTT,酸性磷酸酶活性測定,集落形成實驗,腫瘤細胞粘附到膠原的實驗以及Hoechst染色等分別用于檢測寡核苷酸誘餌對miR-223參與的細胞生長、增殖、粘附及凋亡等生物功能的影響。
結(jié)果:除了與成熟miR-223全長互補
5、的反義寡核苷酸,分別與成熟miR-2235'端,3'端或中間序列互補的誘餌寡核苷酸均抑制miR-223對IGF1R,F(xiàn)OXO1,F(xiàn)OXO3,CDC27,POLR3G,F(xiàn)BXW7等靶mRNA3'UTR的作用,并不同程度的挽救了miR-223所抑制的上述靶mRNA在mRNA和蛋白表達水平。因為PAXIP1不是miR-223的靶點,所以所有誘餌寡核苷酸對其均沒有影響?;贗GF1R3'UTR所設(shè)計的誘餌寡核苷酸1是除外與成熟miR-223全長
6、互補的反義寡核苷酸誘餌4,恢復IGF1R表達最明顯的寡核苷酸誘餌。對于具有與IGF1R3'UTR類似的與miR-223結(jié)合位點的FOXO3和POLR3G,誘餌1也表現(xiàn)出了顯著的挽救效應(yīng);而誘餌1未能恢復Sp1,CDC27和FBXW7的表達。
結(jié)論:本研究實驗數(shù)據(jù)表明具有特異性序列的誘餌寡核苷酸可以作為競爭性外源RNA選擇性的抑制miRNA對靶mRNA的作用。篩選并鑒別對miRNA靶向作用具有選擇性抑制作用的誘餌寡核苷酸對未來臨
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