DNA修復(fù)基因和毒物代謝基因單核苷酸多態(tài)與膀胱癌遺傳易感性.pdf

1、第一部分DNA修復(fù)基因單核苷酸多態(tài)與膀胱尿路上皮癌遺傳易感性研究目的:DNA修復(fù)機(jī)制在防止基因突變,維持基因組穩(wěn)定性過程中起著重要的作用。DNA修復(fù)基因多態(tài)是個(gè)體間DNA修復(fù)能力差異的重要原因。初步探討在上海地區(qū)漢族人群中DNA修復(fù)基因(XPCLys939Gln,XPGHis1104Asp和XRCC1Arg399Gln)單核苷酸多態(tài)性與膀胱尿路上皮癌(移行細(xì)胞癌)遺傳易感性的關(guān)系
　　方法:我們采用病例一對照研究方法,以Taqma

2、n探針實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)和DNA測序等方法對130例病理證實(shí)原發(fā)膀胱尿路上皮癌患者和304例非腫瘤對照的三個(gè)DNA修復(fù)基因(XPCLvs939Gln,XPGHis1104AspandXRCC1Arg399Gln)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行檢測。應(yīng)用非條件Logistic回歸模型,調(diào)整混雜因素后,分析各基因型與膀胱癌罹患風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,還分析了基因-基因、基因-環(huán)境相互作用與膀胱癌風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。
　　結(jié)果:調(diào)整年齡、性別和吸煙因素后,X

3、PC基因Lys939Gln多態(tài)與膀胱癌風(fēng)險(xiǎn)增高相關(guān)。與攜帶XPC939Lys/Lys基因型者比較,Lys/Gln和Gln/Gln基因型者(攜帶Gln突變等位基因者)罹患膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn)增加到2.8倍(校正OR=2.80;95％CI=1.79-4.37)。按年齡分層后,攜帶Gln突變等位基因者(XPC939Lys/Gln雜合基因型和939Gln/Gln基因型)在≥64歲的研究對象中罹患膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn)增加4.17倍(校正OR=4.17;95%CI

4、=2.14-8.16)。再按性別分層分析,與Lys/Lys基因型比較,發(fā)現(xiàn)攜帶Gln突變等位基因的男性發(fā)生膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn)增加2.95倍(校正OR=2.95;95%CI=1.43-6.08)。在重度吸煙人群中(≥25包-年),攜帶至少一個(gè)Gln等位基因者(Lys/Gln基因型+Gln/Gln基因型)罹患膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn)為攜帶Lys/Lys基因型者的5.54倍(95%CI=1.86-16.47)。腫瘤組中,XPC939Gln/Gln和Lys/Gl

5、n基因型頻率在肌層浸潤性膀胱癌患者和腫瘤多發(fā)者中明顯高于非肌層浸潤性膀胱癌患者和腫瘤單發(fā)患者(P<0.05)。與攜帶XPG1104Asp/Asp基因型個(gè)體比較,攜帶His突變等位基因者(攜帶1104Asp/His基因型個(gè)體和攜帶1104His/His基因型個(gè)體)罹患膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn)增高到2.62倍(校正OR=2.62;95%CI=1.61-4.24)。年齡不影響與XPGAsp1104His多態(tài)相關(guān)的膀胱癌風(fēng)險(xiǎn)。再按性別分層分析,與Asp/A

6、sp基因型比較,發(fā)現(xiàn)攜帶His/His純合突變基因型的女性發(fā)生膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn)增高到2.48倍(OR=2.48;95%CI=1.34-4.60)。在不吸煙人群中,攜帶His突變等位基因(His/His+Asp/His基因型)者罹患膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn)為攜帶Asp/Asp基因型者的4.31倍(95%CI=1.19-12.47)。在腫瘤組中,XPGAsp1104His多態(tài)與腫瘤的臨床病理特征無關(guān)。XRCC1基因Arg399Gln多態(tài)與膀胱癌風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)聯(lián)。

7、與野生型基因型比較,突變雜合子和純合子的Ors(95%Cis)分別為0.70(0.43-1.13),1.00(0.65-1.55)。吸煙可以增加膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn),其OR(95%CI)值為3.34(2.01-5.57)。在重度吸煙人群中(≥25包-年),攜帶至少一個(gè)XPC939Gln等位基因者(Lys/Gln基因型+Gln/Gln基因型)罹患膀胱癌的風(fēng)險(xiǎn)為攜帶Lys/Lys基因型者的5.54倍(95%CI=1.86-16.47)。以攜帶XPC

8、939Gln突變等位基因、XPG1104His突變等位基因和XRCC1399Gln突變等位基因?yàn)楦唢L(fēng)險(xiǎn)型。調(diào)整混雜因素后,與不攜帶風(fēng)險(xiǎn)型的個(gè)體相比,攜帶高風(fēng)險(xiǎn)基因型數(shù)量為2個(gè)和3個(gè)位點(diǎn)時(shí),膀胱癌的患病風(fēng)險(xiǎn)分別增高到1.90倍(95%CI:1.13-4.12)和3.59倍(95%CI:1.82-9.26)并且該風(fēng)險(xiǎn)增高效應(yīng)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
　　結(jié)論:本次以上海地區(qū)漢族人群為研究對象的病例對照研究,主要的研究結(jié)果有:吸煙可增加膀胱尿路上

9、皮癌的患病風(fēng)險(xiǎn);XPC基因Lys939Gln和XPG基因Asp1104His的單核苷酸多態(tài)與膀胱尿路上皮癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)聯(lián);重度吸煙和XPC基因939Gln的交互作用可增加膀胱尿路上皮癌的患病風(fēng)險(xiǎn);DNA修復(fù)體系多個(gè)(>2)高風(fēng)險(xiǎn)型SNP的積累可使膀胱尿路上皮癌的患病風(fēng)險(xiǎn)增高。
　　第二部分毒物代謝酶基因單核苷酸多態(tài)與膀胱尿路上皮癌遺傳易感性研究
　　目的:參與環(huán)境化學(xué)物代謝的多種代謝酶具有遺傳多態(tài)性,對于環(huán)境化學(xué)物質(zhì)引起健

10、康損害的個(gè)體易感性有重要的影響作用。在不同的種族和地域人群間多態(tài)性人群頻率特征往往存在顯著差異。初步探討在上海地區(qū)漢族人群中Ⅰ相代謝酶基因(CYP2C9～*3,CYP2C19～*2,CYP2C19～*3,CYP2D6～*10,CYP3A4～*18和CYP3A5～*3)單核苷酸多態(tài)性與膀胱尿路上皮癌(移行細(xì)胞癌)遺傳易感性的關(guān)系
　　方法:我們采用病例一對照研究方法,以Taqman探針實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對130例病理證實(shí)原發(fā)膀胱

11、尿路上皮癌患者和304例非腫瘤對照的6個(gè)Ⅰ相代謝酶基因基因(CYP2C9～*3,CYP2C19～*2,CYP2C19～*3,CYP2D6～*10,CYP3A4～*18和CYP3A5～*3)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行檢測。應(yīng)用非條件Logistic回歸模型,調(diào)整混雜因素后,分析各基因型與膀胱尿路上皮癌罹患風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,還分析了基因-基因、基因-環(huán)境相互作用與膀胱尿路上皮癌風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。
　　結(jié)果:這六個(gè)代謝酶基因單核苷酸多態(tài)各種基因型在正

12、常對照及病例組中的分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。調(diào)整性別、年齡和吸煙情況后,無論是CYP2C9～*3,CYP2C19～*2,CYP2D6～*10,CYP3A4～*18和CYP3A5～*3的突變雜合基因型還是突變純合基因型,均未發(fā)現(xiàn)與膀胱尿路上皮癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)聯(lián)(調(diào)整OR值95%CI分別為突變雜合體1.02[0.61-1.68],0.85[0.47-1.54],1.09[0.67-1.77],1.12[0.67-1.8

13、6]和0.58[0.24-1.38];突變純合體1.02[0.63-1.63],0.98[0.65-1.59],1.50[1.00-2.25],0.92[0.54-1.57]和0.96[0.65-1.40])。CYP2C19～*3的突變等位基因頻率也和膀胱尿路上皮癌風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)(調(diào)整OR:1.01;95%CI=0.42-2.45)。同時(shí)也未觀察到這六個(gè)單核苷酸多態(tài)性與吸煙交互作用對膀胱尿路上皮癌罹患風(fēng)險(xiǎn)的陽性結(jié)果?；?基因聯(lián)合分析顯示:病

14、例組中的所用研究對象中至少攜帶1個(gè)高風(fēng)險(xiǎn)型;兩組中未見有攜帶6個(gè)高風(fēng)險(xiǎn)型者。所以用攜帶1個(gè)高風(fēng)險(xiǎn)型的數(shù)據(jù)作為參照,調(diào)整混雜因素后,隨著攜帶高風(fēng)險(xiǎn)基因型數(shù)量逐漸增多時(shí),并未發(fā)現(xiàn)膀胱尿路上皮癌的患病風(fēng)險(xiǎn)隨之增高。
　　結(jié)論:本次以上海地區(qū)漢族人群為研究對象的病例對照研究結(jié)果:代謝酶基因CYP2C9～*3,CYP2C19～*2,CYP2C19～*3,CYP2D6～*10,CYP3A4～*18和CYP3A5～*3的單核苷酸多態(tài)性與膀胱尿路

15、上皮癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)。
　　第三部分單核苷酸多態(tài)與膀胱尿路上皮癌遺傳易感性:多位點(diǎn)聯(lián)合分析
　　目的:腫瘤是一類復(fù)雜性疾病,它的發(fā)生與眾多低外顯的腫瘤遺傳易感基因之間的相互作用以及基因-環(huán)境之間的交互作用有關(guān)。本研究以130例膀胱尿路上皮癌患者和304例非腫瘤對照為研究對象,選擇了9個(gè)DNA損傷修復(fù)和致癌物代謝相關(guān)的功能性基因單核苷酸多態(tài),包括XPCLys939Gln,XPGHis1104Asp,XRCC1Arg399Gln

16、,CYP2C9～*3,CYP2C19～*2,CYP2C19～*3,CYP2D6～*10,CYP3A4～*18和CYP3A5～*3。
　　方法:在第一章和第二章以非條件logistic回歸方法分別分析了這9個(gè)SNPs單個(gè)位點(diǎn)與腫瘤風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性以及基因和環(huán)境之間的交互作用。為了進(jìn)一步了解這9個(gè)位點(diǎn)之間的相互作用以及具體是哪幾個(gè)位點(diǎn)有交互作用,我們采用用多元縮減法(multifactor-dimensionalityreduction,

17、MDR)分析這9個(gè)單核苷酸多態(tài)之間的相互作用關(guān)系。
　　結(jié)果:本研究候選的9個(gè)基因多態(tài)中,從兩點(diǎn)模型看,XPCLys939Gln和XPGAsp1104His多態(tài)之間的存在交互作用,其相互驗(yàn)證的一致性(cross-validationconsistency,CVC)達(dá)到了10次,從三點(diǎn)模型看,XPCLys939Gln,CYP2D6～*10和CYP3A5～*3基因多態(tài)之間的聯(lián)合效應(yīng)最顯著,CVC達(dá)到了8;四點(diǎn)模型得出XPC、XPG、C