丙肝相關性肝癌蛋白質動態(tài)網(wǎng)絡的初步建立.pdf

1、背景及目的：肝癌是一種惡性程度極高的常見腫瘤。如何對肝癌進行早期的診斷和干預是肝癌研究的重點。目前認為，丙肝肝硬化是肝癌的重要危險因素。本實驗利用生物信息學技術，分析和處理相關高通量數(shù)據(jù)，建立丙肝相關性肝癌蛋白質動態(tài)網(wǎng)絡，從而達到闡釋丙肝相關性肝癌動態(tài)發(fā)展機制的目的。
　　材料及方法：從 GEO數(shù)據(jù)庫中獲取兩組基因表達譜芯片(編號 GSE17967, GSE14323),篩選后將基因芯片分為三組(正常、丙肝肝硬化、丙肝肝硬化伴肝癌

2、)。質量控制后，利用FC方法得到丙肝肝硬化及肝硬化伴隨肝癌兩個病變階段的異常表達基因集，再將得到的基因集投射到蛋白質相互作用關系,以得到相應的蛋白質網(wǎng)絡。
　　結果：建立了丙肝相關性肝癌發(fā)生發(fā)展過程中的蛋白質相互作用動態(tài)網(wǎng)絡，其中按照蛋白質相互作用的不同將網(wǎng)絡分為3種類型：肝硬化到肝癌都發(fā)生異常的蛋白質之間的相互作用，為1型；相互作用一端的蛋白質在肝硬化到肝癌都發(fā)生異常，另一端只在肝癌發(fā)生異常，為2型；只在肝癌中發(fā)生異常的蛋白質之