暗紋東方鲀中BAFF基因相關(guān)性序列的性質(zhì)探討.pdf

1、本研究為解決暗紋東方鲀養(yǎng)殖過程中病蟲害的防治方法，從提高魚體自身免疫出發(fā)，探討存在哪些與哺乳類、鳥類BlyS基因相關(guān)性的DNA序列以及這些序列的性質(zhì)。人B淋巴細(xì)胞刺激因子(又稱為BAFF、BlyS、TALL-1、zTNF4、ntANK)是1999年發(fā)現(xiàn)的腫瘤壞死因子超家族的成員之一，它與某些免疫疾病的致病機(jī)制密切相關(guān)，低量或過量表達(dá)均能引起機(jī)體的免疫失衡。根據(jù)四種已知高度保守的BlyS同源片段設(shè)計引物，同時以草魚、青魚模板做外對照，人模

2、板做陽性對照，經(jīng)PCR擴(kuò)增、割膠回收、克隆測序。結(jié)果表明：以魚基因組為模板經(jīng)PCR擴(kuò)增獲得了542bp、349bp、221bp三條片段；以人基因組為模板獲得5條片段，將最亮一條測序，發(fā)現(xiàn)是位于14號染色體上的片段，與人BlyS沒有相關(guān)性。542bp序列在暗紋東方　和草魚中是非常保守的，A含量最低占18.8％，判斷此段序列屬于紅鰭東方純基因組文庫中“N(任意核苷酸)”區(qū)，填補(bǔ)了紅鰭東方鲀基因組文庫(2007)數(shù)據(jù)的空白。349bp和221

3、bp在暗紋東方魚屯、紅鰭東方鲀及草魚中都是保守的。因此542bp、349bp、221bp三條片段屬于引物特異性擴(kuò)增，但對于BIyS來說是非特異性片段。暗紋東方魚屯和紅鰭東方魚屯序列比對分析顯示：349bp序列中，轉(zhuǎn)換顛換各發(fā)生3次、1次，插入/缺失12次。221bp序列中，堿基替換各1次，插入N/缺失共6次，以上結(jié)果符合大多數(shù)生物DNA序列進(jìn)化中轉(zhuǎn)換大于顛換的現(xiàn)象，但插入或缺失出現(xiàn)的頻率要遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于堿基轉(zhuǎn)換和顛換。在暗紋東方魚屯和紅鰭東方