利用生物信息學手段對糖尿病和前驅(qū)糖尿病進行判別分析的相關(guān)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:
  II型糖尿病(T2D)是一種世界性的疾病。據(jù)估計,全世界有3.47億人患有糖尿病。因此本研究探討用全血白細胞分子譜系的方法來鑒別、正常人和前驅(qū)糖尿病患者的可行性,試圖找出差異性基因來更深層次的研究糖尿病的發(fā)病機制。
  方法:
  總共收集了167個血液樣本,其中包括T2D患者87人,正常人56人,前驅(qū)糖尿病患者24人。T2D診斷標準為體重指數(shù)(Body mass index, BMI)明顯增高以及空腹血糖

2、含量大于126mg/dl,或口服葡萄糖耐量實驗中2h血糖含量大于200mg/dl。用含約20,000個基因的安捷倫Oligo芯片對所有樣本進行基因表達譜分析。用Gene Spring10.0軟件對基因芯片數(shù)據(jù)進行分析,找到倍數(shù)變化值大于2,p值小于0.05的基因,并利用DAVID在線分析工具對差異基因進行染色體定位和功能分析。用spss16.0整合樣本的所有參數(shù)構(gòu)建判別模型,最后用判別模型對樣本進行分類。
  結(jié)果:
  倍

3、數(shù)變化值大于2的基因有79個,差異基因染色體定位分析發(fā)現(xiàn)1個差異基因未知其定位,其余78個差異基因在1號染色體上分布最多,有9個,其次有7個差異基因在2染色體上。從差異基因功能分類看,調(diào)控細胞增殖的差異基因最多。79個差異基因結(jié)合年齡、性別、種族共82個參數(shù),得出最優(yōu)判別模型,該模型可以確認95.1%的樣本,其中T2D組正確率95.9%,正常對照組正確率91.5%,前驅(qū)糖尿病組正確率100%。
  結(jié)論:
  差異基因散在分

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