Ⅱ型糖尿病組織基因表達譜構(gòu)建、分析及相關(guān)病理機制探討.pdf

1、研究背景:在致病機制方面,已鑒定的糖代謝關(guān)聯(lián)位點多數(shù)定位于基因編碼區(qū)之外,提示T2DM可能是轉(zhuǎn)錄調(diào)控過程中“多基因調(diào)控異常”所導(dǎo)致的代謝性綜合癥。
　　目的:1.探討糖尿病模型組大鼠相關(guān)組織受累的分子機制;2.評價大鼠基因表達譜在糖尿病發(fā)病機制研究中的作用以及易感基因作用的分子機制;3.構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),闡釋T2DM發(fā)病機制。
　　方法:1.構(gòu)建類似T2DM的動物模型,采用基因芯片技術(shù),構(gòu)建基因表達譜。2.閱讀并整合組

2、學(xué)數(shù)據(jù)建立T2DM易感基因數(shù)據(jù)集。3.通過RNA-seq和染色質(zhì)免疫沉淀測序數(shù)據(jù),構(gòu)建肝臟轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
　　結(jié)果:1.糖尿病模型大鼠與對照組相比表型差異變化顯著。肝臟和骨骼肌中共享的DEGs富集于“MAPK信號通路”等通路。
　　2.整數(shù)據(jù)共發(fā)現(xiàn)104易感基因。T2DM的易感基因多在肝組織中表達。
　　3.發(fā)現(xiàn) TFBS對應(yīng)的270、51個直接靶基因;整合T2DM大鼠肝臟表達譜,并分別發(fā)現(xiàn)29個、5個重要的直接靶