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文檔簡介
1、本文主要從以下幾部分展開論述:
第一部分 一組α螺旋抗菌肽的預(yù)測(cè)與活性測(cè)定
實(shí)驗(yàn)?zāi)康?α-螺旋抗菌肽是一類具有廣譜抗菌作用的多肽,本文選取抗菌肽CP26的N端1-11個(gè)氨基酸和P18 C端的10-18個(gè)氨基酸雜合,組成新的雜合多肽CP-P(KWKSFIKKLTSKFLHLAKKF)。然后通過氨基酸置換修飾共獲21種抗菌肽,分別檢測(cè)它們的體外抗菌活性和溶血毒性,并通過家兔燒傷模型對(duì)其中活性較好的抗菌肽進(jìn)行體外治療評(píng)價(jià)。
2、
實(shí)驗(yàn)方法:結(jié)合軟件預(yù)測(cè),采用固相多肽合成法合成了19種抗菌肽(CP26、P18、CP-P和16種修飾抗菌肽),通過微板法體外比較了其對(duì)綠膿桿菌的最小抑菌濃度(MIC)、溶血毒性(MHC)和治療指數(shù)(MHC/MIC),并選取抗菌活性最好的抗菌肽K11S16,進(jìn)一步檢測(cè)其對(duì)臨床分離的耐藥菌的最小抑菌濃度及其殺菌的廣譜性。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:雜合多肽CP-P與P18相比,具有較好的抗菌活性,對(duì)綠膿桿菌(CMCC10104)的最小
3、抑菌濃度為12.5μg/ml。將其兩親性的疏水面和親水面分別用不同的氨基酸取代和修飾的二種多肽(S16,K11S16)不但進(jìn)一步提高了其抗綠膿桿菌的活性,降低了其溶血毒性,其中K11S16對(duì)綠膿桿菌的最小抑菌濃度僅為1.6μg/ml,溶血毒性大于500μg/ml,治療指數(shù)相比P18提高了8倍,相比CP26提高了32倍,結(jié)合其對(duì)臨床分離耐藥菌的MIC及家兔燒傷模型的治療結(jié)果,顯示了較好的臨床應(yīng)用前景。
第二部分 LAMP抗菌肽數(shù)
4、據(jù)庫的構(gòu)建
不斷出現(xiàn)的抗生素耐藥菌迫切需要開發(fā)新的抗菌劑。傳統(tǒng)的抗生素開發(fā)方法已經(jīng)難以為繼??咕淖鳛闈撛诘目股?,使得傳統(tǒng)的抗生素開發(fā)方法煥發(fā)新生,這是毋庸置疑的。盡管迄今為止,很多抗菌肽在臨床試驗(yàn)中都失敗了。一個(gè)綜合的,全面的抗菌肽數(shù)據(jù)庫,集成了詳細(xì)的抗菌肽抗菌活性和細(xì)胞毒性信息,將會(huì)加快新的抗菌肽的發(fā)現(xiàn)以及將其轉(zhuǎn)化進(jìn)臨床或者臨床前研究的速度。LAMP,一個(gè)全新的抗菌肽數(shù)據(jù)庫,用來輔助發(fā)現(xiàn)和設(shè)計(jì)抗菌肽。當(dāng)前版本的LAMP數(shù)
5、據(jù)庫共收錄5547條抗菌肽,包括3904條天然抗菌肽和1643條合成抗菌肽。數(shù)據(jù)庫支持通過關(guān)鍵詞或者組合條件進(jìn)行查詢。LAMP擁有詳細(xì)的抗菌活性和細(xì)胞毒性數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)了交叉連接(cross-linking)和最相關(guān)抗菌肽(top similar AMPs)視圖功能,將有助于提高我們對(duì)抗菌肽的了解,并最終加速開發(fā)新的抗菌肽藥物。LAMP可以通過http://biotechlab.fudan.edu.cn/database/lamp自由訪問。
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