基于多源數(shù)據(jù)融合的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建方法研究.pdf

1、蛋白質(zhì)相互作用在生物體的生命活動(dòng)中具有極其重要的作用，幾乎涉及到每一個(gè)生理過程，得到一個(gè)物種中所有的蛋白質(zhì)相互作用對于理解生物機(jī)理具有重大意義。傳統(tǒng)的生物實(shí)驗(yàn)手段通常一次只能檢測出單個(gè)的相互作用，既費(fèi)時(shí)又費(fèi)力，雖然也積累了一些數(shù)據(jù)，但是仍遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。近年來，一些高通量的實(shí)驗(yàn)手段能夠產(chǎn)生大量的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)，然而這些數(shù)據(jù)由于實(shí)驗(yàn)技術(shù)本身的缺陷，具有較高的出錯(cuò)率，大大削弱了這些數(shù)據(jù)的參考價(jià)值。因而從生物信息學(xué)的角度出發(fā)來預(yù)測蛋白質(zhì)相互作用

2、成為了重要的補(bǔ)充手段，成為研究的熱點(diǎn)。 本文從多個(gè)數(shù)據(jù)源出發(fā)，整合了不同類型的數(shù)據(jù)，利用機(jī)器學(xué)習(xí)的方法來預(yù)測模式生物酵母的蛋白質(zhì)相互作用。主要工作包括：搜集和整理網(wǎng)上的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，并對數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理，計(jì)算出需要的各個(gè)屬性數(shù)據(jù)，存儲在本地?cái)?shù)據(jù)庫中；嘗試?yán)貌煌姆椒▽@些數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，預(yù)測蛋白質(zhì)相互作用，并通過生物實(shí)驗(yàn)上證實(shí)的相互作用數(shù)據(jù)驗(yàn)證得到的結(jié)果；提出了一種基于通信模型的分類方法來預(yù)測蛋白質(zhì)擺互作用，并通過與樸素貝葉斯方法的對